RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393190.4

NME2-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME2, Length 866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2-202ENST00000393190 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.87■■■■■ 4.13
NME2-202ENST00000393190 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
NME2-202ENST00000393190 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.85■■■■■ 4.13
NME2-202ENST00000393190 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.84■■■■■ 4.13
NME2-202ENST00000393190 DAPK1P53355 1430 aa40.84■■■■■ 4.13
NME2-202ENST00000393190 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
NME2-202ENST00000393190 NCOA1Q15788 1441 aa40.82■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.8■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.8■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.8■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 PZPP20742 1482 aa40.78■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 KIF15Q9NS87 1388 aa40.77■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.77■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 FBXO41Q8TF61 875 aa40.76■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.76■■■■■ 4.12
NME2-202ENST00000393190 PTPRTO14522 1441 aa40.75■■■■■ 4.11
NME2-202ENST00000393190 ABCC3O15438 1527 aa40.72■■■■■ 4.11
NME2-202ENST00000393190 TNRQ92752 1358 aa40.7■■■■■ 4.11
NME2-202ENST00000393190 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.69■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.68■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 CERKQ8TCT0 537 aa40.67■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.67■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 ERBINQ96RT1 1412 aa40.66■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 CEP152O94986 1710 aa40.64■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 PLA2R1Q13018 1463 aa40.64■■■■■ 4.1
NME2-202ENST00000393190 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.61■■■■■ 4.09
NME2-202ENST00000393190 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
NME2-202ENST00000393190 ADGRL2O95490 1459 aa40.54■■■■■ 4.08
NME2-202ENST00000393190 PKD2Q13563 968 aa40.54■■■■■ 4.08
NME2-202ENST00000393190 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
NME2-202ENST00000393190 DEPDC5O75140 1603 aa40.53■■■■■ 4.08
NME2-202ENST00000393190 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.53■■■■■ 4.08
NME2-202ENST00000393190 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
NME2-202ENST00000393190 ERVK-7P63135 1459 aa40.51■■■■■ 4.07
NME2-202ENST00000393190 NLRP1Q9C000 1473 aa40.51■■■■■ 4.07
NME2-202ENST00000393190 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.073e-7■■□□□ 12.4
NME2-202ENST00000393190 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.49■■■■■ 4.07
NME2-202ENST00000393190 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.43■■■■■ 4.06
NME2-202ENST00000393190 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.42■■■■■ 4.06
NME2-202ENST00000393190 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.41■■■■■ 4.06
NME2-202ENST00000393190 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.4■■■■■ 4.06
NME2-202ENST00000393190 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
NME2-202ENST00000393190 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.39■■■■■ 4.06
NME2-202ENST00000393190 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
NME2-202ENST00000393190 KANK1Q14678 1352 aa40.37■■■■■ 4.05
NME2-202ENST00000393190 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
NME2-202ENST00000393190 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.35■■■■■ 4.05
NME2-202ENST00000393190 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.33■■■■■ 4.05
NME2-202ENST00000393190 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.3■■■■■ 4.04
NME2-202ENST00000393190 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.27■■■■■ 4.04
NME2-202ENST00000393190 ROCK1Q13464 1354 aa40.23■■■■■ 4.03
NME2-202ENST00000393190 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.21■■■■■ 4.03
NME2-202ENST00000393190 MED14O60244 1454 aa40.21■■■■■ 4.03
NME2-202ENST00000393190 ITGAEP38570 1179 aa40.21■■■■■ 4.03
NME2-202ENST00000393190 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.19■■■■■ 4.03
NME2-202ENST00000393190 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
NME2-202ENST00000393190 PIK3C2BO00750 1634 aa40.16■■■■■ 4.02
NME2-202ENST00000393190 SYNMO15061 1565 aa40.15■■■■■ 4.02
NME2-202ENST00000393190 NOS1P29475 1434 aa40.14■■■■■ 4.02
NME2-202ENST00000393190 UNC13BO14795 1591 aa40.14■■■■■ 4.02
NME2-202ENST00000393190 IQGAP1P46940 1657 aa40.11■■■■■ 4.01
NME2-202ENST00000393190 IDI1Q13907 227 aa40.11■■■■■ 4.01
NME2-202ENST00000393190 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.11■■■■■ 4.01
NME2-202ENST00000393190 SLIT1O75093 1534 aa40.09■■■■■ 4.01
NME2-202ENST00000393190 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
NME2-202ENST00000393190 TET3O43151 1660 aa40.08■■■■■ 4.01
NME2-202ENST00000393190 LTKP29376 864 aa40.07■■■■■ 4.01
NME2-202ENST00000393190 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
NME2-202ENST00000393190 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
NME2-202ENST00000393190 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.02■■■■■ 4
NME2-202ENST00000393190 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.02■■■■■ 4
NME2-202ENST00000393190 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
NME2-202ENST00000393190 STAG3Q9UJ98 1225 aa40■■■■□ 3.99
NME2-202ENST00000393190 CPS1P31327 1500 aa40■■■■□ 3.99
NME2-202ENST00000393190 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.99■■■■□ 3.99
NME2-202ENST00000393190 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.98■■■■□ 3.99
NME2-202ENST00000393190 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.95■■■■□ 3.99
NME2-202ENST00000393190 E9PCH4 1651 aa39.95■■■■□ 3.99
NME2-202ENST00000393190 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.95■■■■□ 3.99
NME2-202ENST00000393190 ADGRB3O60242 1522 aa39.94■■■■□ 3.98
NME2-202ENST00000393190 EID1Q9Y6B2 187 aa39.93■■■■□ 3.98
NME2-202ENST00000393190 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.92■■■■□ 3.98
NME2-202ENST00000393190 NUP155O75694 1391 aa39.92■■■■□ 3.98
NME2-202ENST00000393190 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.86■■■■□ 3.97
NME2-202ENST00000393190 NAIPQ13075 1403 aa39.81■■■■□ 3.96
NME2-202ENST00000393190 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.8■■■■□ 3.96
NME2-202ENST00000393190 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.78■■■■□ 3.96
NME2-202ENST00000393190 ZFYVE9O95405 1425 aa39.74■■■■□ 3.95
NME2-202ENST00000393190 ALKQ9UM73 1620 aa39.69■■■■□ 3.94
NME2-202ENST00000393190 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.69■■■■□ 3.94
NME2-202ENST00000393190 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
NME2-202ENST00000393190 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.69■■■■□ 3.94
NME2-202ENST00000393190 TOM1O60784 492 aa39.68■■■■□ 3.94
NME2-202ENST00000393190 HFM1A2PYH4 1435 aa39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms