RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.1■■■■■ 4.33
GIPC1-202ENST00000393028 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
GIPC1-202ENST00000393028 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
GIPC1-202ENST00000393028 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.98■■■■■ 4.31
GIPC1-202ENST00000393028 GGT6Q6P531 493 aa41.98■■■■■ 4.31
GIPC1-202ENST00000393028 CEP152O94986 1710 aa41.97■■■■■ 4.31
GIPC1-202ENST00000393028 MLECQ14165 292 aa41.97■■■■■ 4.31
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM52Q96A61 297 aa41.96■■■■■ 4.31
GIPC1-202ENST00000393028 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.95■■■■■ 4.31
GIPC1-202ENST00000393028 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.94■■■■■ 4.3
GIPC1-202ENST00000393028 HRCP23327 699 aa41.92■■■■■ 4.3
GIPC1-202ENST00000393028 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.92■■■■■ 4.3
GIPC1-202ENST00000393028 NUP155O75694 1391 aa41.92■■■■■ 4.3
GIPC1-202ENST00000393028 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.88■■■■■ 4.29
GIPC1-202ENST00000393028 PZPP20742 1482 aa41.87■■■■■ 4.29
GIPC1-202ENST00000393028 KANK1Q14678 1352 aa41.86■■■■■ 4.29
GIPC1-202ENST00000393028 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
GIPC1-202ENST00000393028 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
GIPC1-202ENST00000393028 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.85■■■■■ 4.29
GIPC1-202ENST00000393028 ABCC3O15438 1527 aa41.84■■■■■ 4.29
GIPC1-202ENST00000393028 TET3O43151 1660 aa41.8■■■■■ 4.28
GIPC1-202ENST00000393028 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.79■■■■■ 4.28
GIPC1-202ENST00000393028 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
GIPC1-202ENST00000393028 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.77■■■■■ 4.28
GIPC1-202ENST00000393028 MADDQ8WXG6 1647 aa41.77■■■■■ 4.28
GIPC1-202ENST00000393028 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.76■■■■■ 4.28
GIPC1-202ENST00000393028 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.75■■■■■ 4.27
GIPC1-202ENST00000393028 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
GIPC1-202ENST00000393028 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.71■■■■■ 4.27
GIPC1-202ENST00000393028 E9PCH4 1651 aa41.71■■■■■ 4.27
GIPC1-202ENST00000393028 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
GIPC1-202ENST00000393028 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.7■■■■■ 4.27
GIPC1-202ENST00000393028 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
GIPC1-202ENST00000393028 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.68■■■■■ 4.26
GIPC1-202ENST00000393028 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
GIPC1-202ENST00000393028 MROH2AA6NES4 1674 aa41.66■■■■■ 4.26
GIPC1-202ENST00000393028 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
GIPC1-202ENST00000393028 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.62■■■■■ 4.25
GIPC1-202ENST00000393028 PKD2Q13563 968 aa41.6■■■■■ 4.25
GIPC1-202ENST00000393028 FOXD1Q16676 465 aa41.59■■■■■ 4.25
GIPC1-202ENST00000393028 C3P01024 1663 aa41.57■■■■■ 4.25
GIPC1-202ENST00000393028 NPATQ14207 1427 aa41.57■■■■■ 4.25
GIPC1-202ENST00000393028 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.52■■■■■ 4.24
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.52■■■■■ 4.24
GIPC1-202ENST00000393028 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.51■■■■■ 4.24
GIPC1-202ENST00000393028 ZMYM3Q14202 1370 aa41.5■■■■■ 4.23
GIPC1-202ENST00000393028 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
GIPC1-202ENST00000393028 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.41■■■■■ 4.22
GIPC1-202ENST00000393028 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
GIPC1-202ENST00000393028 ERVK-7P63135 1459 aa41.41■■■■■ 4.22
GIPC1-202ENST00000393028 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
GIPC1-202ENST00000393028 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.39■■■■■ 4.22
GIPC1-202ENST00000393028 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
GIPC1-202ENST00000393028 SYNMO15061 1565 aa41.38■■■■■ 4.22
GIPC1-202ENST00000393028 PLA2R1Q13018 1463 aa41.38■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 PTPRMP28827 1452 aa41.37■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.37■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 TRPM2O94759 1503 aa41.37■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 PTPRTO14522 1441 aa41.35■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.35■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 NOS1P29475 1434 aa41.35■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.33■■■■■ 4.21
GIPC1-202ENST00000393028 CLTCL1P53675 1640 aa41.3■■■■■ 4.2
GIPC1-202ENST00000393028 PIK3C2BO00750 1634 aa41.25■■■■■ 4.19
GIPC1-202ENST00000393028 TNRQ92752 1358 aa41.22■■■■■ 4.19
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.21■■■■■ 4.19
GIPC1-202ENST00000393028 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.18■■■■■ 4.18
GIPC1-202ENST00000393028 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.18■■■■■ 4.18
GIPC1-202ENST00000393028 KIF1BO60333 1816 aa41.17■■■■■ 4.18
GIPC1-202ENST00000393028 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.15■■■■■ 4.18
GIPC1-202ENST00000393028 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.13■■■■■ 4.17
GIPC1-202ENST00000393028 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
GIPC1-202ENST00000393028 NEUROD1Q13562 356 aa41.09■■■■■ 4.17
GIPC1-202ENST00000393028 IDI1Q13907 227 aa41.07■■■■■ 4.16
GIPC1-202ENST00000393028 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.05■■■■■ 4.16
GIPC1-202ENST00000393028 NLRP1Q9C000 1473 aa41.04■■■■■ 4.16
GIPC1-202ENST00000393028 ADGRB3O60242 1522 aa41.03■■■■■ 4.16
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.03■■■■■ 4.16
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
GIPC1-202ENST00000393028 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.02■■■■■ 4.16
GIPC1-202ENST00000393028 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
GIPC1-202ENST00000393028 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
GIPC1-202ENST00000393028 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.97■■■■■ 4.15
GIPC1-202ENST00000393028 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
GIPC1-202ENST00000393028 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.95■■■■■ 4.15
GIPC1-202ENST00000393028 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.91■■■■■ 4.14
GIPC1-202ENST00000393028 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.91■■■■■ 4.14
GIPC1-202ENST00000393028 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.89■■■■■ 4.14
GIPC1-202ENST00000393028 RGL3Q3MIN7 710 aa40.88■■■■■ 4.13
GIPC1-202ENST00000393028 IFT172Q9UG01 1749 aa40.86■■■■■ 4.13
GIPC1-202ENST00000393028 TONSLQ96HA7 1378 aa40.85■■■■■ 4.13
GIPC1-202ENST00000393028 PPLO60437 1756 aa40.84■■■■■ 4.13
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
GIPC1-202ENST00000393028 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.79■■■■■ 4.12
GIPC1-202ENST00000393028 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
GIPC1-202ENST00000393028 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.77■■■■■ 4.12
GIPC1-202ENST00000393028 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.74■■■■■ 4.11
GIPC1-202ENST00000393028 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.7■■■■■ 4.11
GIPC1-202ENST00000393028 SLIT1O75093 1534 aa40.7■■■■■ 4.11
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.69■■■■■ 4.11
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