RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PXDC1-201ENST00000380277 ROCK1Q13464 1354 aa22.57■■□□□ 1.2
PXDC1-201ENST00000380277 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.57■■□□□ 1.2
PXDC1-201ENST00000380277 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PXDC1-201ENST00000380277 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.55■■□□□ 1.2
PXDC1-201ENST00000380277 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PXDC1-201ENST00000380277 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.52■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.51■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.49■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.48■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.48■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 ZMYM3Q14202 1370 aa22.47■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.47■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PXDC1-201ENST00000380277 MROH2AA6NES4 1674 aa22.45■■□□□ 1.18
PXDC1-201ENST00000380277 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PXDC1-201ENST00000380277 C3P01024 1663 aa22.43■■□□□ 1.18
PXDC1-201ENST00000380277 ABCC3O15438 1527 aa22.43■■□□□ 1.18
PXDC1-201ENST00000380277 DEPDC5O75140 1603 aa22.43■■□□□ 1.18
PXDC1-201ENST00000380277 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PXDC1-201ENST00000380277 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PXDC1-201ENST00000380277 KANK1Q14678 1352 aa22.39■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 NAIPQ13075 1403 aa22.39■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 HFM1A2PYH4 1435 aa22.37■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 NPATQ14207 1427 aa22.37■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.36■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 PZPP20742 1482 aa22.36■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.33■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.33■■□□□ 1.17
PXDC1-201ENST00000380277 UNC13BO14795 1591 aa22.33■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 CEP152O94986 1710 aa22.33■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.33■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.31■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.3■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.3■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.29■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 NUP155O75694 1391 aa22.28■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PXDC1-201ENST00000380277 TNRQ92752 1358 aa22.27■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.26■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 ERVK-7P63135 1459 aa22.25■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.24■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.24■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 HSPA2P54652 639 aa22.22■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.22■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 TET3O43151 1660 aa22.22■■□□□ 1.15
PXDC1-201ENST00000380277 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.19■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 NLRP1Q9C000 1473 aa22.18■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.17■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 TRIM52Q96A61 297 aa22.17■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 NOS1P29475 1434 aa22.16■■□□□ 1.14
PXDC1-201ENST00000380277 E9PCH4 1651 aa22.13■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.13■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 SYNMO15061 1565 aa22.11■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.08■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.08■■□□□ 1.13
PXDC1-201ENST00000380277 IDI1Q13907 227 aa22.07■■□□□ 1.12
PXDC1-201ENST00000380277 PLA2R1Q13018 1463 aa22.06■■□□□ 1.12
PXDC1-201ENST00000380277 PKD2Q13563 968 aa22.06■■□□□ 1.12
PXDC1-201ENST00000380277 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PXDC1-201ENST00000380277 PTPRTO14522 1441 aa22.05■■□□□ 1.12
PXDC1-201ENST00000380277 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.03■■□□□ 1.12
PXDC1-201ENST00000380277 PIK3C2BO00750 1634 aa22.02■■□□□ 1.12
PXDC1-201ENST00000380277 STRCQ7RTU9 1775 aa22.01■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.01■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.01■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 ADGRB3O60242 1522 aa21.98■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.98■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.98■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 TRPM2O94759 1503 aa21.98■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 FOXD1Q16676 465 aa21.97■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.96■■□□□ 1.11
PXDC1-201ENST00000380277 SLIT1O75093 1534 aa21.95■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.95■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.95■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.92■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.91■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 CLTCL1P53675 1640 aa21.9■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 LTKP29376 864 aa21.9■■□□□ 1.1
PXDC1-201ENST00000380277 MED14O60244 1454 aa21.89■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.89■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 EID1Q9Y6B2 187 aa21.89■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.86■■□□□ 1.09
PXDC1-201ENST00000380277 ZFYVE9O95405 1425 aa21.86■■□□□ 1.09
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