RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGAEP38570 1179 aa23.38■■□□□ 1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRL2O95490 1459 aa23.36■■□□□ 1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ERBINQ96RT1 1412 aa23.35■■□□□ 1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO41Q8TF61 875 aa23.35■■□□□ 1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ROCK1Q13464 1354 aa23.34■■□□□ 1.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRKQ15262 1439 aa23.32■■□□□ 1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.32■■□□□ 1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.28■■□□□ 1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZMYM3Q14202 1370 aa23.28■■□□□ 1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.27■■□□□ 1.32
PGGT1B-202ENST00000379615 KANK1Q14678 1352 aa23.25■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.24■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.23■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MROH2AA6NES4 1674 aa23.23■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PGGT1B-202ENST00000379615 C3P01024 1663 aa23.19■■□□□ 1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 NPATQ14207 1427 aa23.18■■□□□ 1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC3O15438 1527 aa23.15■■□□□ 1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.15■■□□□ 1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.15■■□□□ 1.3
PGGT1B-202ENST00000379615 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 DEPDC5O75140 1603 aa23.14■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 PZPP20742 1482 aa23.12■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 STRCQ7RTU9 1775 aa23.12■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 CERKQ8TCT0 537 aa23.12■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 HFM1A2PYH4 1435 aa23.1■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 NAIPQ13075 1403 aa23.09■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.08■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.07■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.06■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 TNRQ92752 1358 aa23.06■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP155O75694 1391 aa23.05■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP152O94986 1710 aa23.05■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.04■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 UNC13BO14795 1591 aa23.03■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.02■■□□□ 1.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK-7P63135 1459 aa22.99■■□□□ 1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM52Q96A61 297 aa22.99■■□□□ 1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 NLRP1Q9C000 1473 aa22.98■■□□□ 1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.97■■□□□ 1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.97■■□□□ 1.27
PGGT1B-202ENST00000379615 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.95■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 TET3O43151 1660 aa22.95■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.95■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.95■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.94■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.93■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRTO14522 1441 aa22.91■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.91■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NOS1P29475 1434 aa22.9■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.89■■□□□ 1.26
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.88■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.86■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.85■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 HRCP23327 699 aa22.85■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PKD2Q13563 968 aa22.85■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 IDI1Q13907 227 aa22.85■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2R1Q13018 1463 aa22.85■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.83■■□□□ 1.25
PGGT1B-202ENST00000379615 E9PCH4 1651 aa22.83■■□□□ 1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.82■■□□□ 1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.8■■□□□ 1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNMO15061 1565 aa22.8■■□□□ 1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PGGT1B-202ENST00000379615 EID1Q9Y6B2 187 aa22.76■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3C2BO00750 1634 aa22.74■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.73■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.73■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.72■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.71■■□□□ 1.23
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRB3O60242 1522 aa22.7■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.7■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 SLIT1O75093 1534 aa22.69■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPM2O94759 1503 aa22.67■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.67■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXD1Q16676 465 aa22.67■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 ILDR2Q71H61 639 aa22.67■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 MED14O60244 1454 aa22.65■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PGGT1B-202ENST00000379615 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.64■■□□□ 1.21
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