RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379018.7

PDLIM4-202, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 1,006 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-202ENST00000379018 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PDLIM4-202ENST00000379018 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PDLIM4-202ENST00000379018 TNRQ92752 1358 aa28.53■■■□□ 2.16
PDLIM4-202ENST00000379018 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.53■■■□□ 2.16
PDLIM4-202ENST00000379018 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.53■■■□□ 2.16
PDLIM4-202ENST00000379018 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PDLIM4-202ENST00000379018 NCOA2Q15596 1464 aa28.5■■■□□ 2.15
PDLIM4-202ENST00000379018 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.49■■■□□ 2.15
PDLIM4-202ENST00000379018 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.48■■■□□ 2.15
PDLIM4-202ENST00000379018 PIP4K2BP78356 416 aa28.47■■■□□ 2.15
PDLIM4-202ENST00000379018 PZPP20742 1482 aa28.46■■■□□ 2.15
PDLIM4-202ENST00000379018 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.45■■■□□ 2.14
PDLIM4-202ENST00000379018 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
PDLIM4-202ENST00000379018 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.39■■■□□ 2.14
PDLIM4-202ENST00000379018 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.39■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 HSPA1LP34931 641 aa28.38■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 CPS1P31327 1500 aa28.38■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.38■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 TSPY4P0CV99 314 aa28.37■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 TSPY10P0CW01 314 aa28.37■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.37■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 MIA2Q96PC5 1412 aa28.36■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.36■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 TOM1O60784 492 aa28.35■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.35■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 NLRP1Q9C000 1473 aa28.33■■■□□ 2.13
PDLIM4-202ENST00000379018 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PDLIM4-202ENST00000379018 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PDLIM4-202ENST00000379018 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.31■■■□□ 2.12
PDLIM4-202ENST00000379018 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PDLIM4-202ENST00000379018 IQGAP1P46940 1657 aa28.27■■■□□ 2.12
PDLIM4-202ENST00000379018 ABCC3O15438 1527 aa28.27■■■□□ 2.12
PDLIM4-202ENST00000379018 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.25■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 DEPDC5O75140 1603 aa28.25■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 MED14O60244 1454 aa28.22■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 CEP152O94986 1710 aa28.22■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 ERVK-7P63135 1459 aa28.21■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.2■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.2■■■□□ 2.11
PDLIM4-202ENST00000379018 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.19■■■□□ 2.1
PDLIM4-202ENST00000379018 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PDLIM4-202ENST00000379018 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PDLIM4-202ENST00000379018 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PDLIM4-202ENST00000379018 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.16■■■□□ 2.1
PDLIM4-202ENST00000379018 ALKQ9UM73 1620 aa28.16■■■□□ 2.1
PDLIM4-202ENST00000379018 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.15■■■□□ 2.1
PDLIM4-202ENST00000379018 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.13■■■□□ 2.09
PDLIM4-202ENST00000379018 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.13■■■□□ 2.09
PDLIM4-202ENST00000379018 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.12■■■□□ 2.09
PDLIM4-202ENST00000379018 SYNMO15061 1565 aa28.1■■■□□ 2.09
PDLIM4-202ENST00000379018 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.09■■■□□ 2.09
PDLIM4-202ENST00000379018 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PDLIM4-202ENST00000379018 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
PDLIM4-202ENST00000379018 KIF15Q9NS87 1388 aa28.06■■■□□ 2.08
PDLIM4-202ENST00000379018 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.05■■■□□ 2.08
PDLIM4-202ENST00000379018 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.05■■■□□ 2.08
PDLIM4-202ENST00000379018 LTKP29376 864 aa28.04■■■□□ 2.08
PDLIM4-202ENST00000379018 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 CROCC2H7BZ55 1655 aa28■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 MAP3K1Q13233 1512 aa28■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.99■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 EID1Q9Y6B2 187 aa27.98■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 ABCC5O15440 1437 aa27.98■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.97■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 PIK3C2BO00750 1634 aa27.97■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.97■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 ERBINQ96RT1 1412 aa27.97■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 SLIT1O75093 1534 aa27.97■■■□□ 2.07
PDLIM4-202ENST00000379018 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.94■■■□□ 2.06
PDLIM4-202ENST00000379018 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PDLIM4-202ENST00000379018 APLP2Q06481 763 aa27.93■■■□□ 2.06
PDLIM4-202ENST00000379018 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.93■■■□□ 2.06
PDLIM4-202ENST00000379018 KANK1Q14678 1352 aa27.93■■■□□ 2.06
PDLIM4-202ENST00000379018 DAPK1P53355 1430 aa27.92■■■□□ 2.06
PDLIM4-202ENST00000379018 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.89■■■□□ 2.06
PDLIM4-202ENST00000379018 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.87■■■□□ 2.05
PDLIM4-202ENST00000379018 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PDLIM4-202ENST00000379018 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.84■■■□□ 2.05
PDLIM4-202ENST00000379018 IDI1Q13907 227 aa27.84■■■□□ 2.05
PDLIM4-202ENST00000379018 TMEM94Q12767 1356 aa27.84■■■□□ 2.05
PDLIM4-202ENST00000379018 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.83■■■□□ 2.05
PDLIM4-202ENST00000379018 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.83■■■□□ 2.05
PDLIM4-202ENST00000379018 BCANQ96GW7 911 aa27.82■■■□□ 2.04
PDLIM4-202ENST00000379018 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PDLIM4-202ENST00000379018 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
PDLIM4-202ENST00000379018 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.77■■■□□ 2.04
PDLIM4-202ENST00000379018 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 KCNA6P17658 529 aa27.76■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 ADGRB3O60242 1522 aa27.76■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.75■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.75■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 NOS1P29475 1434 aa27.72■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 TET3O43151 1660 aa27.72■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
PDLIM4-202ENST00000379018 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.67■■■□□ 2.02
PDLIM4-202ENST00000379018 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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