RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 GGT6Q6P531 493 aa24.46■■□□□ 1.51
PDSS2-201ENST00000369031 C3P01024 1663 aa24.44■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 MROH2AA6NES4 1674 aa24.43■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 ROCK1Q13464 1354 aa24.43■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 DEPDC5O75140 1603 aa24.43■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.42■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.41■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 CEP152O94986 1710 aa24.41■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.4■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.39■■□□□ 1.5
PDSS2-201ENST00000369031 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.38■■□□□ 1.49
PDSS2-201ENST00000369031 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PDSS2-201ENST00000369031 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.37■■□□□ 1.49
PDSS2-201ENST00000369031 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC3O15438 1527 aa24.35■■□□□ 1.49
PDSS2-201ENST00000369031 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PDSS2-201ENST00000369031 UNC13BO14795 1591 aa24.33■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.32■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 NAIPQ13075 1403 aa24.3■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 ZMYM3Q14202 1370 aa24.29■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.29■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.29■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.29■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 HFM1A2PYH4 1435 aa24.27■■□□□ 1.48
PDSS2-201ENST00000369031 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.26■■□□□ 1.47
PDSS2-201ENST00000369031 PZPP20742 1482 aa24.24■■□□□ 1.47
PDSS2-201ENST00000369031 KANK1Q14678 1352 aa24.23■■□□□ 1.47
PDSS2-201ENST00000369031 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.22■■□□□ 1.47
PDSS2-201ENST00000369031 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.22■■□□□ 1.47
PDSS2-201ENST00000369031 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.21■■□□□ 1.47
PDSS2-201ENST00000369031 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.2■■□□□ 1.47
PDSS2-201ENST00000369031 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.2■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 NPATQ14207 1427 aa24.19■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 TET3O43151 1660 aa24.19■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 ERVK-7P63135 1459 aa24.15■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.15■■□□□ 1.46
PDSS2-201ENST00000369031 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.14■■□□□ 1.45
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.13■■□□□ 1.45
PDSS2-201ENST00000369031 E9PCH4 1651 aa24.13■■□□□ 1.45
PDSS2-201ENST00000369031 NUP155O75694 1391 aa24.13■■□□□ 1.45
PDSS2-201ENST00000369031 TNRQ92752 1358 aa24.11■■□□□ 1.45
PDSS2-201ENST00000369031 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PDSS2-201ENST00000369031 SYNMO15061 1565 aa24.08■■□□□ 1.44
PDSS2-201ENST00000369031 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.07■■□□□ 1.44
PDSS2-201ENST00000369031 HSPA2P54652 639 aa24.06■■□□□ 1.44
PDSS2-201ENST00000369031 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PDSS2-201ENST00000369031 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.03■■□□□ 1.44
PDSS2-201ENST00000369031 TRIM52Q96A61 297 aa24.03■■□□□ 1.44
PDSS2-201ENST00000369031 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.03■■□□□ 1.44
PDSS2-201ENST00000369031 NLRP1Q9C000 1473 aa24.01■■□□□ 1.43
PDSS2-201ENST00000369031 NOS1P29475 1434 aa24.01■■□□□ 1.43
PDSS2-201ENST00000369031 PIK3C2BO00750 1634 aa23.99■■□□□ 1.43
PDSS2-201ENST00000369031 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.99■■□□□ 1.43
PDSS2-201ENST00000369031 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.98■■□□□ 1.43
PDSS2-201ENST00000369031 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.97■■□□□ 1.43
PDSS2-201ENST00000369031 STRCQ7RTU9 1775 aa23.95■■□□□ 1.42
PDSS2-201ENST00000369031 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PDSS2-201ENST00000369031 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.91■■□□□ 1.42
PDSS2-201ENST00000369031 ADGRB3O60242 1522 aa23.9■■□□□ 1.42
PDSS2-201ENST00000369031 PKD2Q13563 968 aa23.89■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 TRPM2O94759 1503 aa23.88■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 CLTCL1P53675 1640 aa23.88■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 PLA2R1Q13018 1463 aa23.87■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 PTPRTO14522 1441 aa23.87■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 IDI1Q13907 227 aa23.86■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 FOXD1Q16676 465 aa23.86■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.84■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.84■■□□□ 1.41
PDSS2-201ENST00000369031 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.82■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.81■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.81■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 SLIT1O75093 1534 aa23.79■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.79■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.79■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 KIF1BO60333 1816 aa23.77■■□□□ 1.4
PDSS2-201ENST00000369031 HRCP23327 699 aa23.76■■□□□ 1.39
PDSS2-201ENST00000369031 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PDSS2-201ENST00000369031 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.74■■□□□ 1.39
PDSS2-201ENST00000369031 IQGAP1P46940 1657 aa23.73■■□□□ 1.39
PDSS2-201ENST00000369031 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PDSS2-201ENST00000369031 ZFYVE9O95405 1425 aa23.7■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.7■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 MED14O60244 1454 aa23.68■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.68■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.68■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 LTKP29376 864 aa23.68■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.65■■□□□ 1.38
PDSS2-201ENST00000369031 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.64■■□□□ 1.38
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