RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-207ENST00000368226 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRK-207ENST00000368226 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRK-207ENST00000368226 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-207ENST00000368226 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-207ENST00000368226 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
PTPRK-207ENST00000368226 PTPRGP23470 1445 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 NECTIN2Q92692 538 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 PLIN1O60240 522 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 EVA1CP58658 441 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 TOMM22Q9NS69 142 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 MSH5O43196 834 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 NLRP13Q86W25 1043 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 COG3Q96JB2 828 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 GPATCH3Q96I76 525 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 NRDCO43847 1150 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 OSCARQ8IYS5 282 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRK-207ENST00000368226 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 HMMRO75330 724 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 SMARCA4P51532 1647 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 MSNP26038 577 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 PDE4CQ08493 712 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 ARID3AQ99856 593 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 KIF15Q9NS87 1388 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 RILPL2Q969X0 211 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 CFAP44Q96MT7 982 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 EVC2Q86UK5 1308 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 GBP4Q96PP9 640 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 VPS53Q5VIR6 699 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
PTPRK-207ENST00000368226 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 PRDM2Q13029 1718 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 PSME1Q06323 249 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 USP47Q96K76 1375 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 TEFQ10587 303 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 APAF1O14727 1248 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 30.5
PTPRK-207ENST00000368226 RAD21O60216 631 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 COG6Q9Y2V7 657 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 UACAQ9BZF9 1416 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 HMOX1P09601 288 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 SLC4A3P48751 1232 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 CRBNQ96SW2 442 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-207ENST00000368226 KLHL34Q8N239 644 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 FBXW7Q969H0 707 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 CABP2Q9NPB3 220 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 RIPK4P57078 832 aa16■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 MARCH6O60337 910 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 KIF16BQ96L93 1317 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 PDE3BQ13370 1112 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 USP35Q9P2H5 1018 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 IGF1RP08069 1367 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 E9PSI1 815 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRK-207ENST00000368226 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.96■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 ST18O60284 1047 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRK-207ENST00000368226 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms