RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366988.4

NENF-201, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NENF, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-201ENST00000366988 NPATQ14207 1427 aa31.32■■■□□ 2.61
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NENF-201ENST00000366988 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
NENF-201ENST00000366988 KIF15Q9NS87 1388 aa31.3■■■□□ 2.6
NENF-201ENST00000366988 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.26■■■□□ 2.6
NENF-201ENST00000366988 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.26■■■□□ 2.59
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NENF-201ENST00000366988 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.24■■■□□ 2.59
NENF-201ENST00000366988 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.24■■■□□ 2.59
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NENF-201ENST00000366988 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.18■■■□□ 2.58
NENF-201ENST00000366988 PZPP20742 1482 aa31.17■■■□□ 2.58
NENF-201ENST00000366988 ADGRL2O95490 1459 aa31.16■■■□□ 2.58
NENF-201ENST00000366988 ABCC3O15438 1527 aa31.16■■■□□ 2.58
NENF-201ENST00000366988 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
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NENF-201ENST00000366988 CEP152O94986 1710 aa31.15■■■□□ 2.58
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NENF-201ENST00000366988 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
NENF-201ENST00000366988 DEPDC5O75140 1603 aa31.1■■■□□ 2.57
NENF-201ENST00000366988 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.09■■■□□ 2.57
NENF-201ENST00000366988 TNRQ92752 1358 aa31.08■■■□□ 2.57
NENF-201ENST00000366988 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
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NENF-201ENST00000366988 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.03■■■□□ 2.56
NENF-201ENST00000366988 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.03■■■□□ 2.56
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NENF-201ENST00000366988 ITGAEP38570 1179 aa30.99■■■□□ 2.55
NENF-201ENST00000366988 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.99■■■□□ 2.55
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NENF-201ENST00000366988 PLA2R1Q13018 1463 aa30.96■■■□□ 2.55
NENF-201ENST00000366988 NLRP1Q9C000 1473 aa30.96■■■□□ 2.55
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NENF-201ENST00000366988 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
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NENF-201ENST00000366988 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.89■■■□□ 2.54
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NENF-201ENST00000366988 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
NENF-201ENST00000366988 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.85■■■□□ 2.53
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NENF-201ENST00000366988 PIK3C2BO00750 1634 aa30.73■■■□□ 2.51
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NENF-201ENST00000366988 SYNMO15061 1565 aa30.71■■■□□ 2.51
NENF-201ENST00000366988 NOS1P29475 1434 aa30.7■■■□□ 2.5
NENF-201ENST00000366988 NUP155O75694 1391 aa30.68■■■□□ 2.5
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NENF-201ENST00000366988 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.66■■■□□ 2.5
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NENF-201ENST00000366988 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.49
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NENF-201ENST00000366988 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
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NENF-201ENST00000366988 TRIM52Q96A61 297 aa30.46■■■□□ 2.47
NENF-201ENST00000366988 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
NENF-201ENST00000366988 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.37■■■□□ 2.45
NENF-201ENST00000366988 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.37■■■□□ 2.45
NENF-201ENST00000366988 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
NENF-201ENST00000366988 ZFYVE9O95405 1425 aa30.36■■■□□ 2.45
NENF-201ENST00000366988 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
NENF-201ENST00000366988 TRPM2O94759 1503 aa30.33■■■□□ 2.45
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