RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362803.1

SNORD16-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 16, humanhuman

BASIC

Gene SNORD16, Length 99 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD16-201ENST00000362803 TRIM52Q96A61 297 aa9.48□□□□□ -0.89
SNORD16-201ENST00000362803 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SNORD16-201ENST00000362803 GGT6Q6P531 493 aa9.46□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 NUP155O75694 1391 aa9.46□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 FAM135AQ9P2D6 1515 aa9.45□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.45□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.44□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 UNC13BO14795 1591 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 MLECQ14165 292 aa9.43□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 DEPDC5O75140 1603 aa9.42□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.41□□□□□ -0.9
SNORD16-201ENST00000362803 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.4□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.39□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.38□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.37□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 ABCC3O15438 1527 aa9.37□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 PZPP20742 1482 aa9.37□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 PKD2Q13563 968 aa9.37□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.37□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.36□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 TET3O43151 1660 aa9.36□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.35□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 ZMYM3Q14202 1370 aa9.35□□□□□ -0.91
SNORD16-201ENST00000362803 NPATQ14207 1427 aa9.33□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.33□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 MROH2AA6NES4 1674 aa9.32□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 CEP152O94986 1710 aa9.32□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.32□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.32□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.31□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.31□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 MADDQ8WXG6 1647 aa9.31□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 PTPRTO14522 1441 aa9.31□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.3□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 FOXD1Q16676 465 aa9.3□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 NOS1P29475 1434 aa9.3□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 E9PCH4 1651 aa9.29□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 ERVK-7P63135 1459 aa9.29□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 TRPM2O94759 1503 aa9.29□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 PTPRMP28827 1452 aa9.28□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 TNRQ92752 1358 aa9.28□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.28□□□□□ -0.92
SNORD16-201ENST00000362803 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.27□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 STAG3Q9UJ98 1225 aa9.27□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.27□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 NLRP1Q9C000 1473 aa9.27□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.26□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.26□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 NEUROD1Q13562 356 aa9.26□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 PLA2R1Q13018 1463 aa9.26□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 C3P01024 1663 aa9.26□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.26□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 TONSLQ96HA7 1378 aa9.25□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 STAC3Q96MF2 364 aa9.25□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 IDI1Q13907 227 aa9.24□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.24□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.23□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 SYNMO15061 1565 aa9.23□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.23□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.23□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.21□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 PIK3C2BO00750 1634 aa9.21□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 CLTCL1P53675 1640 aa9.21□□□□□ -0.93
SNORD16-201ENST00000362803 RGL3Q3MIN7 710 aa9.21□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 ADGRB3O60242 1522 aa9.21□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.2□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.2□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 VGFO15240 615 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 EID1Q9Y6B2 187 aa9.19□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.19□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 KIF1BO60333 1816 aa9.19□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.18□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.18□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SNORD16-201ENST00000362803 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms