RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.69□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 NUP155O75694 1391 aa14.69□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.68□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 UNC13BO14795 1591 aa14.68□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 ABCA6Q8N139 1617 aa14.67□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.67□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 ATP10AO60312 1499 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 PZPP20742 1482 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 KIF3BO15066 747 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.65□□□□□ -0.06
GINS3-201ENST00000318129 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 KANK1Q14678 1352 aa14.64□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 DEPDC5O75140 1603 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 REREQ9P2R6 1566 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 PKD2Q13563 968 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 AGLP35573 1532 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GINS3-201ENST00000318129 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 GGT6Q6P531 493 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 FOXD1Q16676 465 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 MIER1Q8N108 512 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 TET3O43151 1660 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-201ENST00000318129 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 ABCC3O15438 1527 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 E9PCH4 1651 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 CEP152O94986 1710 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 TONSLQ96HA7 1378 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 PTPRTO14522 1441 aa14.46□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.46□□□□□ -0.09
GINS3-201ENST00000318129 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.46□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 PLA2R1Q13018 1463 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 MLECQ14165 292 aa14.44□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.43□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 TRPM2O94759 1503 aa14.43□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 NPATQ14207 1427 aa14.43□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.41□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
GINS3-201ENST00000318129 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.39□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 NOS1P29475 1434 aa14.39□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 ZMYM3Q14202 1370 aa14.36□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.35□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 CLTCL1P53675 1640 aa14.35□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 MROH2AA6NES4 1674 aa14.35□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.35□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.34□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.34□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 STAC3Q96MF2 364 aa14.34□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 ERVK-7P63135 1459 aa14.33□□□□□ -0.11
GINS3-201ENST00000318129 KIF1BO60333 1816 aa14.33□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.32□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 SYNMO15061 1565 aa14.31□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.31□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 RGL3Q3MIN7 710 aa14.31□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 PIK3C2BO00750 1634 aa14.3□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.3□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.3□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.29□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 IDI1Q13907 227 aa14.29□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.28□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 ADGRB3O60242 1522 aa14.27□□□□□ -0.12
GINS3-201ENST00000318129 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.27□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.27□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 TNRQ92752 1358 aa14.27□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.25□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 C3P01024 1663 aa14.25□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 MADDQ8WXG6 1647 aa14.25□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.23□□□□□ -0.13
GINS3-201ENST00000318129 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.2 ms