RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 ERBINQ96RT1 1412 aa23.47■■□□□ 1.35
CHTF18-202ENST00000317063 KDM5CP41229 1560 aa23.46■■□□□ 1.35
CHTF18-202ENST00000317063 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 RICTORQ6R327 1708 aa23.45■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.45■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 TONSLQ96HA7 1378 aa23.45■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.43■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.41■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 UNC13BO14795 1591 aa23.41■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 GGT6Q6P531 493 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 ABCA6Q8N139 1617 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 A2MP01023 1474 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.39■■□□□ 1.34
CHTF18-202ENST00000317063 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CHTF18-202ENST00000317063 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.37■■□□□ 1.33
CHTF18-202ENST00000317063 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.34■■□□□ 1.33
CHTF18-202ENST00000317063 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.33■■□□□ 1.33
CHTF18-202ENST00000317063 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.32■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.32■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 DEPDC5O75140 1603 aa23.28■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.28■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 KANK1Q14678 1352 aa23.28■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 PLA2R1Q13018 1463 aa23.27■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CHTF18-202ENST00000317063 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 RGL3Q3MIN7 710 aa23.25■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 E9PCH4 1651 aa23.24■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.23■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.23■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 MLECQ14165 292 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 CEP152O94986 1710 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.21■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.21■■□□□ 1.31
CHTF18-202ENST00000317063 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.2■■□□□ 1.3
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.2■■□□□ 1.3
CHTF18-202ENST00000317063 ATP10AO60312 1499 aa23.19■■□□□ 1.3
CHTF18-202ENST00000317063 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-202ENST00000317063 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-202ENST00000317063 TET3O43151 1660 aa23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-202ENST00000317063 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.17■■□□□ 1.3
CHTF18-202ENST00000317063 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-202ENST00000317063 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-202ENST00000317063 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.1■■□□□ 1.29
CHTF18-202ENST00000317063 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.1■■□□□ 1.29
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC3O15438 1527 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-202ENST00000317063 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.09■■□□□ 1.29
CHTF18-202ENST00000317063 NPATQ14207 1427 aa23.08■■□□□ 1.29
CHTF18-202ENST00000317063 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 PTPRTO14522 1441 aa23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.06■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 CLTCL1P53675 1640 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 TRPM2O94759 1503 aa23.04■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.03■■□□□ 1.28
CHTF18-202ENST00000317063 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-202ENST00000317063 REREQ9P2R6 1566 aa22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-202ENST00000317063 AGLP35573 1532 aa22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-202ENST00000317063 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-202ENST00000317063 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 IDI1Q13907 227 aa22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 KIF1BO60333 1816 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 NOS1P29475 1434 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 SYNMO15061 1565 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.89■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 MROH2AA6NES4 1674 aa22.89■■□□□ 1.26
CHTF18-202ENST00000317063 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.89■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.86■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 ZMYM3Q14202 1370 aa22.85■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.85■■□□□ 1.25
CHTF18-202ENST00000317063 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.82■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 USP47Q96K76 1375 aa22.82■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 ERVK-7P63135 1459 aa22.81■■□□□ 1.24
CHTF18-202ENST00000317063 MIER1Q8N108 512 aa22.8■■□□□ 1.24
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