RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 HRCP23327 699 aa23.68■■□□□ 1.38
LSMEM2-201ENST00000316436 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
LSMEM2-201ENST00000316436 AGLP35573 1532 aa23.66■■□□□ 1.38
LSMEM2-201ENST00000316436 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.66■■□□□ 1.38
LSMEM2-201ENST00000316436 PZPP20742 1482 aa23.66■■□□□ 1.38
LSMEM2-201ENST00000316436 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.64■■□□□ 1.38
LSMEM2-201ENST00000316436 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
LSMEM2-201ENST00000316436 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.6■■□□□ 1.37
LSMEM2-201ENST00000316436 CEP152O94986 1710 aa23.58■■□□□ 1.37
LSMEM2-201ENST00000316436 KIF3BO15066 747 aa23.58■■□□□ 1.37
LSMEM2-201ENST00000316436 NUP155O75694 1391 aa23.56■■□□□ 1.36
LSMEM2-201ENST00000316436 TRIM52Q96A61 297 aa23.55■■□□□ 1.36
LSMEM2-201ENST00000316436 TET3O43151 1660 aa23.53■■□□□ 1.36
LSMEM2-201ENST00000316436 ABCC3O15438 1527 aa23.52■■□□□ 1.36
LSMEM2-201ENST00000316436 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
LSMEM2-201ENST00000316436 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.52■■□□□ 1.36
LSMEM2-201ENST00000316436 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
LSMEM2-201ENST00000316436 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
LSMEM2-201ENST00000316436 E9PCH4 1651 aa23.5■■□□□ 1.35
LSMEM2-201ENST00000316436 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.49■■□□□ 1.35
LSMEM2-201ENST00000316436 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.49■■□□□ 1.35
LSMEM2-201ENST00000316436 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.48■■□□□ 1.35
LSMEM2-201ENST00000316436 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2-201ENST00000316436 GGT6Q6P531 493 aa23.45■■□□□ 1.34
LSMEM2-201ENST00000316436 KANK1Q14678 1352 aa23.45■■□□□ 1.34
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2-201ENST00000316436 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
LSMEM2-201ENST00000316436 FOXD1Q16676 465 aa23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2-201ENST00000316436 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2-201ENST00000316436 PKD2Q13563 968 aa23.39■■□□□ 1.34
LSMEM2-201ENST00000316436 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 MLECQ14165 292 aa23.37■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 MROH2AA6NES4 1674 aa23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 PLA2R1Q13018 1463 aa23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 NPATQ14207 1427 aa23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 MADDQ8WXG6 1647 aa23.35■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.35■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.34■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.33■■□□□ 1.33
LSMEM2-201ENST00000316436 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.33■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.32■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 TRPM2O94759 1503 aa23.32■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.3■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 PTPRTO14522 1441 aa23.3■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 SYNMO15061 1565 aa23.29■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 CLTCL1P53675 1640 aa23.28■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 C3P01024 1663 aa23.28■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.27■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.27■■□□□ 1.32
LSMEM2-201ENST00000316436 NOS1P29475 1434 aa23.26■■□□□ 1.31
LSMEM2-201ENST00000316436 ERVK-7P63135 1459 aa23.25■■□□□ 1.31
LSMEM2-201ENST00000316436 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.25■■□□□ 1.31
LSMEM2-201ENST00000316436 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.24■■□□□ 1.31
LSMEM2-201ENST00000316436 PIK3C2BO00750 1634 aa23.24■■□□□ 1.31
LSMEM2-201ENST00000316436 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LSMEM2-201ENST00000316436 ZMYM3Q14202 1370 aa23.21■■□□□ 1.31
LSMEM2-201ENST00000316436 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.18■■□□□ 1.3
LSMEM2-201ENST00000316436 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
LSMEM2-201ENST00000316436 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
LSMEM2-201ENST00000316436 NEUROD1Q13562 356 aa23.13■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 ADGRB3O60242 1522 aa23.13■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 KIF1BO60333 1816 aa23.12■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.12■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.11■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.11■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.1■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 PTPRMP28827 1452 aa23.09■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.09■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.08■■□□□ 1.29
LSMEM2-201ENST00000316436 TNRQ92752 1358 aa23.07■■□□□ 1.28
LSMEM2-201ENST00000316436 IFT172Q9UG01 1749 aa23.06■■□□□ 1.28
LSMEM2-201ENST00000316436 TONSLQ96HA7 1378 aa23.04■■□□□ 1.28
LSMEM2-201ENST00000316436 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.02■■□□□ 1.28
LSMEM2-201ENST00000316436 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LSMEM2-201ENST00000316436 IDI1Q13907 227 aa23.01■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 PPLO60437 1756 aa23■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.99■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 NLRP1Q9C000 1473 aa22.99■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.98■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.98■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.97■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.97■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.97■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
LSMEM2-201ENST00000316436 RGL3Q3MIN7 710 aa22.92■■□□□ 1.26
LSMEM2-201ENST00000316436 MYOM2P54296 1465 aa22.91■■□□□ 1.26
LSMEM2-201ENST00000316436 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LSMEM2-201ENST00000316436 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.89■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.88■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 ZFYVE9O95405 1425 aa22.88■■□□□ 1.25
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