RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 DEPDC5O75140 1603 aa26.9■■□□□ 1.9
TMED3-201ENST00000299705 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.89■■□□□ 1.9
TMED3-201ENST00000299705 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.87■■□□□ 1.89
TMED3-201ENST00000299705 UNC13BO14795 1591 aa26.87■■□□□ 1.89
TMED3-201ENST00000299705 GGT6Q6P531 493 aa26.87■■□□□ 1.89
TMED3-201ENST00000299705 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.86■■□□□ 1.89
TMED3-201ENST00000299705 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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TMED3-201ENST00000299705 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.83■■□□□ 1.89
TMED3-201ENST00000299705 KANK1Q14678 1352 aa26.81■■□□□ 1.88
TMED3-201ENST00000299705 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.883e-6■■■□□ 16.2
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TMED3-201ENST00000299705 NUP155O75694 1391 aa26.78■■□□□ 1.88
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TMED3-201ENST00000299705 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
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TMED3-201ENST00000299705 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.74■■□□□ 1.87
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TMED3-201ENST00000299705 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.72■■□□□ 1.87
TMED3-201ENST00000299705 MADDQ8WXG6 1647 aa26.7■■□□□ 1.87
TMED3-201ENST00000299705 CEP152O94986 1710 aa26.7■■□□□ 1.86
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TMED3-201ENST00000299705 MROH2AA6NES4 1674 aa26.67■■□□□ 1.86
TMED3-201ENST00000299705 TET3O43151 1660 aa26.67■■□□□ 1.86
TMED3-201ENST00000299705 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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TMED3-201ENST00000299705 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.64■■□□□ 1.86
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TMED3-201ENST00000299705 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.64■■□□□ 1.85
TMED3-201ENST00000299705 ZMYM3Q14202 1370 aa26.64■■□□□ 1.85
TMED3-201ENST00000299705 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.63■■□□□ 1.85
TMED3-201ENST00000299705 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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TMED3-201ENST00000299705 E9PCH4 1651 aa26.58■■□□□ 1.84
TMED3-201ENST00000299705 PKD2Q13563 968 aa26.57■■□□□ 1.84
TMED3-201ENST00000299705 C3P01024 1663 aa26.57■■□□□ 1.84
TMED3-201ENST00000299705 PTPRMP28827 1452 aa26.56■■□□□ 1.84
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TMED3-201ENST00000299705 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.49■■□□□ 1.83
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TMED3-201ENST00000299705 ERVK-7P63135 1459 aa26.49■■□□□ 1.83
TMED3-201ENST00000299705 NOS1P29475 1434 aa26.48■■□□□ 1.83
TMED3-201ENST00000299705 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
TMED3-201ENST00000299705 PTPRTO14522 1441 aa26.47■■□□□ 1.83
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TMED3-201ENST00000299705 TRPM2O94759 1503 aa26.41■■□□□ 1.82
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TMED3-201ENST00000299705 SYNMO15061 1565 aa26.4■■□□□ 1.82
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TMED3-201ENST00000299705 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.37■■□□□ 1.81
TMED3-201ENST00000299705 PIK3C2BO00750 1634 aa26.35■■□□□ 1.81
TMED3-201ENST00000299705 NLRP1Q9C000 1473 aa26.34■■□□□ 1.81
TMED3-201ENST00000299705 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.32■■□□□ 1.8
TMED3-201ENST00000299705 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.32■■□□□ 1.8
TMED3-201ENST00000299705 IDI1Q13907 227 aa26.31■■□□□ 1.8
TMED3-201ENST00000299705 CLTCL1P53675 1640 aa26.3■■□□□ 1.8
TMED3-201ENST00000299705 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.3■■□□□ 1.8
TMED3-201ENST00000299705 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.3■■□□□ 1.8
TMED3-201ENST00000299705 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TMED3-201ENST00000299705 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.27■■□□□ 1.8
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TMED3-201ENST00000299705 ADGRB3O60242 1522 aa26.21■■□□□ 1.79
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TMED3-201ENST00000299705 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.2■■□□□ 1.78
TMED3-201ENST00000299705 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.19■■□□□ 1.78
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TMED3-201ENST00000299705 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.18■■□□□ 1.78
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TMED3-201ENST00000299705 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.12■■□□□ 1.77
TMED3-201ENST00000299705 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.09■■□□□ 1.77
TMED3-201ENST00000299705 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.09■■□□□ 1.77
TMED3-201ENST00000299705 SLIT1O75093 1534 aa26.09■■□□□ 1.77
TMED3-201ENST00000299705 RGL3Q3MIN7 710 aa26.08■■□□□ 1.77
TMED3-201ENST00000299705 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
TMED3-201ENST00000299705 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.08■■□□□ 1.77
TMED3-201ENST00000299705 ZFYVE9O95405 1425 aa26.05■■□□□ 1.76
TMED3-201ENST00000299705 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
TMED3-201ENST00000299705 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.04■■□□□ 1.76
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