RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294742.6

ARPC5-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC5, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5-201ENST00000294742 UNC13BO14795 1591 aa24.8■■□□□ 1.56
ARPC5-201ENST00000294742 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.79■■□□□ 1.56
ARPC5-201ENST00000294742 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 GGT6Q6P531 493 aa24.75■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 TRIM52Q96A61 297 aa24.74■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.552e-7■■■□□ 17.6
ARPC5-201ENST00000294742 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.73■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 NUP155O75694 1391 aa24.73■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.71■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
ARPC5-201ENST00000294742 MLECQ14165 292 aa24.7■■□□□ 1.54
ARPC5-201ENST00000294742 PZPP20742 1482 aa24.69■■□□□ 1.54
ARPC5-201ENST00000294742 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.69■■□□□ 1.54
ARPC5-201ENST00000294742 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.68■■□□□ 1.54
ARPC5-201ENST00000294742 KANK1Q14678 1352 aa24.66■■□□□ 1.54
ARPC5-201ENST00000294742 ABCC3O15438 1527 aa24.64■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 CEP152O94986 1710 aa24.63■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.63■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.63■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.62■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.62■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 TET3O43151 1660 aa24.58■■□□□ 1.53
ARPC5-201ENST00000294742 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.56■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.56■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.55■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 PKD2Q13563 968 aa24.55■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.54■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 FOXD1Q16676 465 aa24.53■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 E9PCH4 1651 aa24.53■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 MADDQ8WXG6 1647 aa24.53■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
ARPC5-201ENST00000294742 NPATQ14207 1427 aa24.51■■□□□ 1.51
ARPC5-201ENST00000294742 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.51■■□□□ 1.51
ARPC5-201ENST00000294742 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.5■■□□□ 1.51
ARPC5-201ENST00000294742 ZMYM3Q14202 1370 aa24.48■■□□□ 1.51
ARPC5-201ENST00000294742 MROH2AA6NES4 1674 aa24.48■■□□□ 1.51
ARPC5-201ENST00000294742 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ARPC5-201ENST00000294742 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ARPC5-201ENST00000294742 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.43■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 PLA2R1Q13018 1463 aa24.43■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 PTPRTO14522 1441 aa24.42■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 C3P01024 1663 aa24.42■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 NOS1P29475 1434 aa24.4■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.4■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.39■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.39■■□□□ 1.5
ARPC5-201ENST00000294742 ERVK-7P63135 1459 aa24.39■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.37■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 TRPM2O94759 1503 aa24.36■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 SYNMO15061 1565 aa24.36■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.36■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 PTPRMP28827 1452 aa24.36■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.33■■□□□ 1.49
ARPC5-201ENST00000294742 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.33■■□□□ 1.48
ARPC5-201ENST00000294742 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.32■■□□□ 1.48
ARPC5-201ENST00000294742 CLTCL1P53675 1640 aa24.3■■□□□ 1.48
ARPC5-201ENST00000294742 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.3■■□□□ 1.48
ARPC5-201ENST00000294742 PIK3C2BO00750 1634 aa24.29■■□□□ 1.48
ARPC5-201ENST00000294742 TNRQ92752 1358 aa24.28■■□□□ 1.48
ARPC5-201ENST00000294742 NEUROD1Q13562 356 aa24.24■■□□□ 1.47
ARPC5-201ENST00000294742 IDI1Q13907 227 aa24.24■■□□□ 1.47
ARPC5-201ENST00000294742 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.24■■□□□ 1.47
ARPC5-201ENST00000294742 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.19■■□□□ 1.46
ARPC5-201ENST00000294742 NLRP1Q9C000 1473 aa24.19■■□□□ 1.46
ARPC5-201ENST00000294742 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.18■■□□□ 1.46
ARPC5-201ENST00000294742 ADGRB3O60242 1522 aa24.17■■□□□ 1.46
ARPC5-201ENST00000294742 KIF1BO60333 1816 aa24.16■■□□□ 1.46
ARPC5-201ENST00000294742 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.15■■□□□ 1.46
ARPC5-201ENST00000294742 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.14■■□□□ 1.46
ARPC5-201ENST00000294742 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 RGL3Q3MIN7 710 aa24.12■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.12■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.11■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.1■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 TONSLQ96HA7 1378 aa24.1■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.08■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.08■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.08■■□□□ 1.45
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ARPC5-201ENST00000294742 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.05■■□□□ 1.44
ARPC5-201ENST00000294742 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.02■■□□□ 1.44
ARPC5-201ENST00000294742 IFT172Q9UG01 1749 aa24.02■■□□□ 1.43
ARPC5-201ENST00000294742 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.01■■□□□ 1.43
ARPC5-201ENST00000294742 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24■■□□□ 1.43
ARPC5-201ENST00000294742 PPLO60437 1756 aa24■■□□□ 1.43
ARPC5-201ENST00000294742 ZFYVE9O95405 1425 aa24■■□□□ 1.43
ARPC5-201ENST00000294742 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms