RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294613.9

TM2D1-201, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D1, Length 1,250 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-201ENST00000294613 CEP152O94986 1710 aa27.02■■□□□ 1.92
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TM2D1-201ENST00000294613 TSPY10P0CW01 314 aa26.98■■□□□ 1.91
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TM2D1-201ENST00000294613 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.65■■□□□ 1.86
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TM2D1-201ENST00000294613 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.64■■□□□ 1.85
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TM2D1-201ENST00000294613 SYNMO15061 1565 aa26.63■■□□□ 1.85
TM2D1-201ENST00000294613 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
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TM2D1-201ENST00000294613 KANK1Q14678 1352 aa26.58■■□□□ 1.85
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TM2D1-201ENST00000294613 E9PCH4 1651 aa26.55■■□□□ 1.84
TM2D1-201ENST00000294613 IQGAP1P46940 1657 aa26.55■■□□□ 1.84
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TM2D1-201ENST00000294613 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.51■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 FBXO41Q8TF61 875 aa26.51■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 NOS1P29475 1434 aa26.5■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 CERKQ8TCT0 537 aa26.5■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 MED14O60244 1454 aa26.49■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 ADGRB3O60242 1522 aa26.48■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 SLIT1O75093 1534 aa26.48■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 ITGAEP38570 1179 aa26.47■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.47■■□□□ 1.83
TM2D1-201ENST00000294613 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
TM2D1-201ENST00000294613 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.44■■□□□ 1.82
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TM2D1-201ENST00000294613 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.42■■□□□ 1.82
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TM2D1-201ENST00000294613 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
TM2D1-201ENST00000294613 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.39■■□□□ 1.81
TM2D1-201ENST00000294613 NAIPQ13075 1403 aa26.38■■□□□ 1.81
TM2D1-201ENST00000294613 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.37■■□□□ 1.81
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TM2D1-201ENST00000294613 HFM1A2PYH4 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
TM2D1-201ENST00000294613 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.32■■□□□ 1.8
TM2D1-201ENST00000294613 NUP155O75694 1391 aa26.31■■□□□ 1.8
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TM2D1-201ENST00000294613 ALKQ9UM73 1620 aa26.21■■□□□ 1.79
TM2D1-201ENST00000294613 TRPM2O94759 1503 aa26.2■■□□□ 1.79
TM2D1-201ENST00000294613 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.19■■□□□ 1.78
TM2D1-201ENST00000294613 NWD1Q149M9 1564 aa26.18■■□□□ 1.78
TM2D1-201ENST00000294613 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.18■■□□□ 1.78
TM2D1-201ENST00000294613 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.17■■□□□ 1.78
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