RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 MADDQ8WXG6 1647 aa26.42■■□□□ 1.82
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CCDC78-201ENST00000293889 TRIM52Q96A61 297 aa26.35■■□□□ 1.81
CCDC78-201ENST00000293889 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
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CCDC78-201ENST00000293889 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC78-201ENST00000293889 UNC13BO14795 1591 aa26.29■■□□□ 1.8
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CCDC78-201ENST00000293889 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.21■■□□□ 1.79
CCDC78-201ENST00000293889 C3P01024 1663 aa26.21■■□□□ 1.79
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CCDC78-201ENST00000293889 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.19■■□□□ 1.78
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CCDC78-201ENST00000293889 ZMYM3Q14202 1370 aa26.13■■□□□ 1.77
CCDC78-201ENST00000293889 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.13■■□□□ 1.77
CCDC78-201ENST00000293889 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.11■■□□□ 1.77
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CCDC78-201ENST00000293889 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.09■■□□□ 1.77
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CCDC78-201ENST00000293889 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.02■■□□□ 1.76
CCDC78-201ENST00000293889 E9PCH4 1651 aa26.01■■□□□ 1.75
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CCDC78-201ENST00000293889 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.99■■□□□ 1.75
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.99■■□□□ 1.75
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CCDC78-201ENST00000293889 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.94■■□□□ 1.74
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CCDC78-201ENST00000293889 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.92■■□□□ 1.74
CCDC78-201ENST00000293889 PTPRTO14522 1441 aa25.9■■□□□ 1.74
CCDC78-201ENST00000293889 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.9■■□□□ 1.74
CCDC78-201ENST00000293889 TNRQ92752 1358 aa25.89■■□□□ 1.74
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CCDC78-201ENST00000293889 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.86■■□□□ 1.73
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CCDC78-201ENST00000293889 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
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CCDC78-201ENST00000293889 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.78■■□□□ 1.72
CCDC78-201ENST00000293889 CLTCL1P53675 1640 aa25.77■■□□□ 1.72
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CCDC78-201ENST00000293889 PIK3C2BO00750 1634 aa25.76■■□□□ 1.71
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CCDC78-201ENST00000293889 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.69■■□□□ 1.7
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CCDC78-201ENST00000293889 STRCQ7RTU9 1775 aa25.67■■□□□ 1.7
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CCDC78-201ENST00000293889 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CCDC78-201ENST00000293889 RGL3Q3MIN7 710 aa25.64■■□□□ 1.7
CCDC78-201ENST00000293889 KIF1BO60333 1816 aa25.64■■□□□ 1.69
CCDC78-201ENST00000293889 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CCDC78-201ENST00000293889 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.61■■□□□ 1.69
CCDC78-201ENST00000293889 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CCDC78-201ENST00000293889 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.58■■□□□ 1.69
CCDC78-201ENST00000293889 SLIT1O75093 1534 aa25.56■■□□□ 1.68
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