RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TPM4P67936 248 aa26.34■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 PANK3Q9H999 370 aa26.34■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.33■■□□□ 1.81
CCSAP-201ENST00000284617 FAM161AQ3B820 660 aa26.33■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.32■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 PDE4AP27815 886 aa26.31■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.31■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.31■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 E9PSI1 815 aa26.31■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 GORABQ5T7V8 394 aa26.3■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 DDX11L8A8MPP1 907 aa26.3■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.28■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 PHF14O94880 888 aa26.28■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 UACAQ9BZF9 1416 aa26.27■■□□□ 1.8
CCSAP-201ENST00000284617 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.25■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 USP47Q96K76 1375 aa26.25■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 NGEFQ8N5V2 710 aa26.24■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 JPH4Q96JJ6 628 aa26.24■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.24■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 AMPHP49418 695 aa26.23■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 KIF3AQ9Y496 699 aa26.23■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.22■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 EID1Q9Y6B2 187 aa26.22■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.21■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 KIF16BQ96L93 1317 aa26.21■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.2■■□□□ 1.79
CCSAP-201ENST00000284617 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.2■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.789e-8■■□□□ 13.9
CCSAP-201ENST00000284617 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.18■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 CRBNQ96SW2 442 aa26.17■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 PLIN1O60240 522 aa26.17■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 CLSTN1O94985 981 aa26.15■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 EVC2Q86UK5 1308 aa26.15■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.14■■□□□ 1.78
CCSAP-201ENST00000284617 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.14■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 GSE1Q14687 1217 aa26.14■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.14■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.13■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.12■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.12■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 COG6Q9Y2V7 657 aa26.11■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 APAF1O14727 1248 aa26.1■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.09■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 COG3Q96JB2 828 aa26.08■■□□□ 1.77
CCSAP-201ENST00000284617 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 ARID3AQ99856 593 aa26.06■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A3P48751 1232 aa26.06■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 RILPL2Q969X0 211 aa26.05■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 REC8O95072 547 aa26.03■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.03■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.03■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.03■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 STAC3Q96MF2 364 aa26.02■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCA4P51532 1647 aa26.02■■□□□ 1.76
CCSAP-201ENST00000284617 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa26■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRGP23470 1445 aa26■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC7Q96M83 1385 aa26■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 H3BQV1 296 aa26■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 IFFO2Q5TF58 517 aa26■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 NUTM2FA1L443 756 aa25.99■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 AAMPQ13685 434 aa25.98■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.98■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM22Q9NS69 142 aa25.98■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 TPM3P06753 285 aa25.97■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.97■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.97■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.96■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.96■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.96■■□□□ 1.75
CCSAP-201ENST00000284617 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.95■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa25.95■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 RUNDC1Q96C34 613 aa25.94■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 TEFQ10587 303 aa25.94■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 ROCK1Q13464 1354 aa25.94■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.93■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9 ms