RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.3■■□□□ 1.48
FBXO4-201ENST00000281623 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FBXO4-201ENST00000281623 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FBXO4-201ENST00000281623 KIF15Q9NS87 1388 aa24.29■■□□□ 1.48
FBXO4-201ENST00000281623 TRIM52Q96A61 297 aa24.28■■□□□ 1.48
FBXO4-201ENST00000281623 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.27■■□□□ 1.48
FBXO4-201ENST00000281623 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.27■■□□□ 1.48
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.25■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 MADDQ8WXG6 1647 aa24.25■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 ERBINQ96RT1 1412 aa24.23■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 NEUROD1Q13562 356 aa24.23■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.23■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 MLECQ14165 292 aa24.21■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 PZPP20742 1482 aa24.21■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FBXO4-201ENST00000281623 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FBXO4-201ENST00000281623 KIF3BO15066 747 aa24.17■■□□□ 1.46
FBXO4-201ENST00000281623 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.16■■□□□ 1.46
FBXO4-201ENST00000281623 DEPDC5O75140 1603 aa24.16■■□□□ 1.46
FBXO4-201ENST00000281623 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.13■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 TONSLQ96HA7 1378 aa24.13■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 GGT6Q6P531 493 aa24.13■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.13■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 PTPRMP28827 1452 aa24.12■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 MROH2AA6NES4 1674 aa24.12■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.11■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 CEP152O94986 1710 aa24.09■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.08■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.08■■□□□ 1.45
FBXO4-201ENST00000281623 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 UNC13BO14795 1591 aa24.08■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 FOXD1Q16676 465 aa24.06■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 C3P01024 1663 aa24.06■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 NUP155O75694 1391 aa24.05■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 ABCC3O15438 1527 aa24.02■■□□□ 1.44
FBXO4-201ENST00000281623 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.01■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.01■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 KANK1Q14678 1352 aa24.01■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 PKD2Q13563 968 aa23.98■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.97■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 ZMYM3Q14202 1370 aa23.96■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.95■■□□□ 1.43
FBXO4-201ENST00000281623 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
FBXO4-201ENST00000281623 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
FBXO4-201ENST00000281623 TET3O43151 1660 aa23.94■■□□□ 1.42
FBXO4-201ENST00000281623 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
FBXO4-201ENST00000281623 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.92■■□□□ 1.42
FBXO4-201ENST00000281623 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.91■■□□□ 1.42
FBXO4-201ENST00000281623 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.88■■□□□ 1.41
FBXO4-201ENST00000281623 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.88■■□□□ 1.41
FBXO4-201ENST00000281623 NPATQ14207 1427 aa23.87■■□□□ 1.41
FBXO4-201ENST00000281623 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.87■■□□□ 1.41
FBXO4-201ENST00000281623 E9PCH4 1651 aa23.85■■□□□ 1.41
FBXO4-201ENST00000281623 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
FBXO4-201ENST00000281623 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.83■■□□□ 1.41
FBXO4-201ENST00000281623 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.82■■□□□ 1.4
FBXO4-201ENST00000281623 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.81■■□□□ 1.4
FBXO4-201ENST00000281623 ERVK-7P63135 1459 aa23.81■■□□□ 1.4
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
FBXO4-201ENST00000281623 PLA2R1Q13018 1463 aa23.77■■□□□ 1.4
FBXO4-201ENST00000281623 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.76■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 TNRQ92752 1358 aa23.76■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.76■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 SYNMO15061 1565 aa23.73■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 NOS1P29475 1434 aa23.72■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.72■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.71■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 NLRP1Q9C000 1473 aa23.71■■□□□ 1.39
FBXO4-201ENST00000281623 PIK3C2BO00750 1634 aa23.67■■□□□ 1.38
FBXO4-201ENST00000281623 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.67■■□□□ 1.38
FBXO4-201ENST00000281623 HSPA2P54652 639 aa23.67■■□□□ 1.38
FBXO4-201ENST00000281623 MIER1Q8N108 512 aa23.66■■□□□ 1.38
FBXO4-201ENST00000281623 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
FBXO4-201ENST00000281623 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
FBXO4-201ENST00000281623 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.64■■□□□ 1.38
FBXO4-201ENST00000281623 TRPM2O94759 1503 aa23.64■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 PTPRTO14522 1441 aa23.63■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.63■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.61■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.6■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.6■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 KIF1BO60333 1816 aa23.59■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 CLTCL1P53675 1640 aa23.59■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 ADGRB3O60242 1522 aa23.58■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.58■■□□□ 1.37
FBXO4-201ENST00000281623 STRCQ7RTU9 1775 aa23.58■■□□□ 1.36
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