RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274605.5

N4BP3-201, Transcript of NEDD4 binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene N4BP3, Length 6,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3-201ENST00000274605 PANK3Q9H999 370 aa22.43■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 JPH4Q96JJ6 628 aa22.42■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 PTMSP20962 102 aa22.4■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.39■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.39■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.39■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.39■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 ARID3AQ99856 593 aa22.39■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 KIF15Q9NS87 1388 aa22.38■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.37■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 PLIN1O60240 522 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 PDE3BQ13370 1112 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 TOMM22Q9NS69 142 aa22.33■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.33■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 G3V3G9 751 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.29■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 RILPL2Q969X0 211 aa22.29■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 COG3Q96JB2 828 aa22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 TPM4P67936 248 aa22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.27■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.27■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 ST18O60284 1047 aa22.25■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.25■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 NGEFQ8N5V2 710 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 KIF16BQ96L93 1317 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 EVC2Q86UK5 1308 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 SLC4A3P48751 1232 aa22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 CRBNQ96SW2 442 aa22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 USP47Q96K76 1375 aa22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 PDE4CQ08493 712 aa22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 COG6Q9Y2V7 657 aa22.21■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 NECTIN2Q92692 538 aa22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 UACAQ9BZF9 1416 aa22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 E9PSI1 815 aa22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 APAF1O14727 1248 aa22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 PTPRGP23470 1445 aa22.18■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 EVA1CP58658 441 aa22.18■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.17■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 VPS53Q5VIR6 699 aa22.17■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 TEFQ10587 303 aa22.16■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 PDE4AP27815 886 aa22.16■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 H3BQV1 296 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 IFFO2Q5TF58 517 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 FAM161AQ3B820 660 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 MARCH6O60337 910 aa22.14■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.11■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 RIPK4P57078 832 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 PHF14O94880 888 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 KIF3AQ9Y496 699 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.09■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.08■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 MSH5O43196 834 aa22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 SMARCA4P51532 1647 aa22.06■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 MCTP1Q6DN14 999 aa22.05■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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