RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274605.5

N4BP3-201, Transcript of NEDD4 binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene N4BP3, Length 6,080 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3-201ENST00000274605 PANK3Q9H999 370 aa22.43■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 JPH4Q96JJ6 628 aa22.42■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 PTMSP20962 102 aa22.4■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.39■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.39■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.39■■□□□ 1.18
N4BP3-201ENST00000274605 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.39■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 ARID3AQ99856 593 aa22.39■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 KIF15Q9NS87 1388 aa22.38■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.37■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 PLIN1O60240 522 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 PDE3BQ13370 1112 aa22.36■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 TOMM22Q9NS69 142 aa22.33■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.33■■□□□ 1.17
N4BP3-201ENST00000274605 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 G3V3G9 751 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.31■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.29■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 RILPL2Q969X0 211 aa22.29■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 COG3Q96JB2 828 aa22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 TPM4P67936 248 aa22.28■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.27■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.27■■□□□ 1.16
N4BP3-201ENST00000274605 ST18O60284 1047 aa22.25■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.25■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 NGEFQ8N5V2 710 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 KIF16BQ96L93 1317 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 EVC2Q86UK5 1308 aa22.24■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 SLC4A3P48751 1232 aa22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 CRBNQ96SW2 442 aa22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 USP47Q96K76 1375 aa22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 PDE4CQ08493 712 aa22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 COG6Q9Y2V7 657 aa22.21■■□□□ 1.15
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 NECTIN2Q92692 538 aa22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 UACAQ9BZF9 1416 aa22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 E9PSI1 815 aa22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 APAF1O14727 1248 aa22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.19■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 PTPRGP23470 1445 aa22.18■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 EVA1CP58658 441 aa22.18■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.17■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 VPS53Q5VIR6 699 aa22.17■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 TEFQ10587 303 aa22.16■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 PDE4AP27815 886 aa22.16■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 H3BQV1 296 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 IFFO2Q5TF58 517 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 FAM161AQ3B820 660 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.15■■□□□ 1.14
N4BP3-201ENST00000274605 MARCH6O60337 910 aa22.14■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.11■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 RIPK4P57078 832 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 PHF14O94880 888 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 KIF3AQ9Y496 699 aa22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.09■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.08■■□□□ 1.13
N4BP3-201ENST00000274605 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 MSH5O43196 834 aa22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 SMARCA4P51532 1647 aa22.06■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 MCTP1Q6DN14 999 aa22.05■■□□□ 1.12
N4BP3-201ENST00000274605 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms