RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270560.3

TM4SF5-201, Transcript of transmembrane 4 L six family member 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM4SF5, Length 708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5-201ENST00000270560 PTPRKQ15262 1439 aa31.69■■■□□ 2.66
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TM4SF5-201ENST00000270560 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.65■■■□□ 2.66
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TM4SF5-201ENST00000270560 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.63■■■□□ 2.65
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TM4SF5-201ENST00000270560 HFM1A2PYH4 1435 aa31.3■■■□□ 2.6
TM4SF5-201ENST00000270560 UNC13BO14795 1591 aa31.29■■■□□ 2.6
TM4SF5-201ENST00000270560 ERVK-7P63135 1459 aa31.28■■■□□ 2.6
TM4SF5-201ENST00000270560 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.27■■■□□ 2.6
TM4SF5-201ENST00000270560 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.27■■■□□ 2.6
TM4SF5-201ENST00000270560 NUP155O75694 1391 aa31.25■■■□□ 2.59
TM4SF5-201ENST00000270560 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.25■■■□□ 2.59
TM4SF5-201ENST00000270560 NLRP1Q9C000 1473 aa31.24■■■□□ 2.59
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TM4SF5-201ENST00000270560 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
TM4SF5-201ENST00000270560 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.19■■■□□ 2.58
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TM4SF5-201ENST00000270560 TET3O43151 1660 aa31.15■■■□□ 2.58
TM4SF5-201ENST00000270560 NOS1P29475 1434 aa31.14■■■□□ 2.58
TM4SF5-201ENST00000270560 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
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TM4SF5-201ENST00000270560 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.03■■■□□ 2.56
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TM4SF5-201ENST00000270560 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
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TM4SF5-201ENST00000270560 E9PCH4 1651 aa31■■■□□ 2.55
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TM4SF5-201ENST00000270560 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.99■■■□□ 2.55
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TM4SF5-201ENST00000270560 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.91■■■□□ 2.54
TM4SF5-201ENST00000270560 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.89■■■□□ 2.54
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TM4SF5-201ENST00000270560 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.85■■■□□ 2.53
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TM4SF5-201ENST00000270560 ZFYVE9O95405 1425 aa30.73■■■□□ 2.51
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TM4SF5-201ENST00000270560 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
TM4SF5-201ENST00000270560 IQGAP1P46940 1657 aa30.7■■■□□ 2.5
TM4SF5-201ENST00000270560 CLTCL1P53675 1640 aa30.69■■■□□ 2.5
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