RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264720.7

GTF3C2-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C2, Length 3,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-201ENST00000264720 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF3C2-201ENST00000264720 ERBINQ96RT1 1412 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF3C2-201ENST00000264720 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GTF3C2-201ENST00000264720 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.84□□□□□ -0.03
GTF3C2-201ENST00000264720 PKD2Q13563 968 aa14.84□□□□□ -0.03
GTF3C2-201ENST00000264720 FOXD1Q16676 465 aa14.83□□□□□ -0.03
GTF3C2-201ENST00000264720 NEO1Q92859 1461 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 ATP7AQ04656 1500 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 GLI2P10070 1586 aa14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 UNC13BO14795 1591 aa14.8□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.043e-7■■□□□ 12.3
GTF3C2-201ENST00000264720 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.78□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C2-201ENST00000264720 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 KANK1Q14678 1352 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 DIP2BQ9P265 1576 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 KDM5CP41229 1560 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 KIF3BO15066 747 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 IL27Q8NEV9 243 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C2-201ENST00000264720 A2MP01023 1474 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C2-201ENST00000264720 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-201ENST00000264720 DEPDC5O75140 1603 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-201ENST00000264720 RAPGEF3O95398 923 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-201ENST00000264720 TSPOAP1O95153 1857 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-201ENST00000264720 RICTORQ6R327 1708 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-201ENST00000264720 TET3O43151 1660 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 ATP10AO60312 1499 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 ABCA6Q8N139 1617 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 E9PCH4 1651 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 PLA2R1Q13018 1463 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 GGT6Q6P531 493 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.58□□□□□ -0.07
GTF3C2-201ENST00000264720 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 TRPM2O94759 1503 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 RGL3Q3MIN7 710 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 PTPRTO14522 1441 aa14.56□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 CEP152O94986 1710 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 STAC3Q96MF2 364 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C2-201ENST00000264720 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 ABCC3O15438 1527 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 REREQ9P2R6 1566 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 CLTCL1P53675 1640 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 USP47Q96K76 1375 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 KIF1BO60333 1816 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 AGLP35573 1532 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 NPATQ14207 1427 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF3C2-201ENST00000264720 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms