RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258100.8

SMYD5-201, Transcript of SMYD family member 5, humanhuman

TSL 5

Gene SMYD5, Length 786 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5-201ENST00000258100 CEP162Q5TB80 1403 aa27.52■■■□□ 2
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SMYD5-201ENST00000258100 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
SMYD5-201ENST00000258100 HSPA1LP34931 641 aa27.48■■□□□ 1.99
SMYD5-201ENST00000258100 PZPP20742 1482 aa27.48■■□□□ 1.99
SMYD5-201ENST00000258100 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.46■■□□□ 1.99
SMYD5-201ENST00000258100 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.46■■□□□ 1.99
SMYD5-201ENST00000258100 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.45■■□□□ 1.99
SMYD5-201ENST00000258100 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.44■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 PIP4K2BP78356 416 aa27.44■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 ALKQ9UM73 1620 aa27.44■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 NCOA2Q15596 1464 aa27.44■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.43■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 CPS1P31327 1500 aa27.41■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SMYD5-201ENST00000258100 MIA2Q96PC5 1412 aa27.39■■□□□ 1.97
SMYD5-201ENST00000258100 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.38■■□□□ 1.97
SMYD5-201ENST00000258100 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.37■■□□□ 1.97
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SMYD5-201ENST00000258100 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SMYD5-201ENST00000258100 MED14O60244 1454 aa27.33■■□□□ 1.97
SMYD5-201ENST00000258100 NLRP1Q9C000 1473 aa27.33■■□□□ 1.97
SMYD5-201ENST00000258100 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.33■■□□□ 1.97
SMYD5-201ENST00000258100 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.32■■□□□ 1.96
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SMYD5-201ENST00000258100 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.31■■□□□ 1.96
SMYD5-201ENST00000258100 TOM1O60784 492 aa27.31■■□□□ 1.96
SMYD5-201ENST00000258100 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
SMYD5-201ENST00000258100 ABCC3O15438 1527 aa27.29■■□□□ 1.96
SMYD5-201ENST00000258100 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
SMYD5-201ENST00000258100 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.27■■□□□ 1.96
SMYD5-201ENST00000258100 IQGAP1P46940 1657 aa27.26■■□□□ 1.95
SMYD5-201ENST00000258100 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.25■■□□□ 1.95
SMYD5-201ENST00000258100 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.24■■□□□ 1.95
SMYD5-201ENST00000258100 ERVK-7P63135 1459 aa27.23■■□□□ 1.95
SMYD5-201ENST00000258100 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
SMYD5-201ENST00000258100 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.21■■□□□ 1.95
SMYD5-201ENST00000258100 TSPY4P0CV99 314 aa27.19■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 TSPY10P0CW01 314 aa27.19■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.19■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 CEP152O94986 1710 aa27.16■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.14■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SMYD5-201ENST00000258100 SYNMO15061 1565 aa27.12■■□□□ 1.93
SMYD5-201ENST00000258100 LTKP29376 864 aa27.11■■□□□ 1.93
SMYD5-201ENST00000258100 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SMYD5-201ENST00000258100 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SMYD5-201ENST00000258100 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.08■■□□□ 1.93
SMYD5-201ENST00000258100 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.08■■□□□ 1.93
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SMYD5-201ENST00000258100 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.01■■□□□ 1.91
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SMYD5-201ENST00000258100 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.99■■□□□ 1.91
SMYD5-201ENST00000258100 ABCC5O15440 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
SMYD5-201ENST00000258100 KIF15Q9NS87 1388 aa26.98■■□□□ 1.91
SMYD5-201ENST00000258100 PIK3C2BO00750 1634 aa26.98■■□□□ 1.91
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SMYD5-201ENST00000258100 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.93■■□□□ 1.9
SMYD5-201ENST00000258100 ERBINQ96RT1 1412 aa26.92■■□□□ 1.9
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SMYD5-201ENST00000258100 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.87■■□□□ 1.89
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SMYD5-201ENST00000258100 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.86■■□□□ 1.89
SMYD5-201ENST00000258100 EID1Q9Y6B2 187 aa26.86■■□□□ 1.89
SMYD5-201ENST00000258100 TET3O43151 1660 aa26.85■■□□□ 1.89
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SMYD5-201ENST00000258100 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.83■■□□□ 1.89
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SMYD5-201ENST00000258100 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.79■■□□□ 1.88
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SMYD5-201ENST00000258100 KANK1Q14678 1352 aa26.76■■□□□ 1.87
SMYD5-201ENST00000258100 NWD1Q149M9 1564 aa26.75■■□□□ 1.87
SMYD5-201ENST00000258100 ADGRB3O60242 1522 aa26.75■■□□□ 1.87
SMYD5-201ENST00000258100 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SMYD5-201ENST00000258100 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.71■■□□□ 1.87
SMYD5-201ENST00000258100 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SMYD5-201ENST00000258100 ZFYVE9O95405 1425 aa26.67■■□□□ 1.86
SMYD5-201ENST00000258100 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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