RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000238558.4

GSC-201, Transcript of goosecoid homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GSC, Length 1,264 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC-201ENST00000238558 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.47■■■■■ 4.07
GSC-201ENST00000238558 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.46■■■■■ 4.07
GSC-201ENST00000238558 STRCQ7RTU9 1775 aa40.44■■■■■ 4.06
GSC-201ENST00000238558 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
GSC-201ENST00000238558 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.42■■■■■ 4.06
GSC-201ENST00000238558 KIF15Q9NS87 1388 aa40.42■■■■■ 4.06
GSC-201ENST00000238558 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.41■■■■■ 4.06
GSC-201ENST00000238558 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
GSC-201ENST00000238558 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
GSC-201ENST00000238558 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.38■■■■■ 4.05
GSC-201ENST00000238558 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
GSC-201ENST00000238558 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.37■■■■■ 4.05
GSC-201ENST00000238558 PZPP20742 1482 aa40.36■■■■■ 4.05
GSC-201ENST00000238558 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
GSC-201ENST00000238558 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.34■■■■■ 4.05
GSC-201ENST00000238558 NCOA1Q15788 1441 aa40.33■■■■■ 4.05
GSC-201ENST00000238558 ERBINQ96RT1 1412 aa40.3■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 ABCC3O15438 1527 aa40.3■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.3■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.3■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 TNRQ92752 1358 aa40.29■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.29■■■■■ 4.04
GSC-201ENST00000238558 PTPRTO14522 1441 aa40.25■■■■■ 4.03
GSC-201ENST00000238558 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
GSC-201ENST00000238558 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.23■■■■■ 4.03
GSC-201ENST00000238558 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
GSC-201ENST00000238558 FBXO41Q8TF61 875 aa40.2■■■■■ 4.03
GSC-201ENST00000238558 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.18■■■■■ 4.02
GSC-201ENST00000238558 ADGRL2O95490 1459 aa40.18■■■■■ 4.02
GSC-201ENST00000238558 PLA2R1Q13018 1463 aa40.17■■■■■ 4.02
GSC-201ENST00000238558 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
GSC-201ENST00000238558 CEP152O94986 1710 aa40.15■■■■■ 4.02
GSC-201ENST00000238558 CERKQ8TCT0 537 aa40.14■■■■■ 4.02
GSC-201ENST00000238558 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.02
GSC-201ENST00000238558 PKD2Q13563 968 aa40.12■■■■■ 4.01
GSC-201ENST00000238558 DEPDC5O75140 1603 aa40.1■■■■■ 4.01
GSC-201ENST00000238558 NLRP1Q9C000 1473 aa40.1■■■■■ 4.01
GSC-201ENST00000238558 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.09■■■■■ 4.01
GSC-201ENST00000238558 ERVK-7P63135 1459 aa40.08■■■■■ 4.01
GSC-201ENST00000238558 KANK1Q14678 1352 aa40.06■■■■■ 4
GSC-201ENST00000238558 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.04■■■■■ 4
GSC-201ENST00000238558 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
GSC-201ENST00000238558 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
GSC-201ENST00000238558 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40■■■■□ 3.99
GSC-201ENST00000238558 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.98■■■■□ 3.99
GSC-201ENST00000238558 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.97■■■■□ 3.99
GSC-201ENST00000238558 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
GSC-201ENST00000238558 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.96■■■■□ 3.99
GSC-201ENST00000238558 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.93■■■■□ 3.98
GSC-201ENST00000238558 ROCK1Q13464 1354 aa39.93■■■■□ 3.98
GSC-201ENST00000238558 ITGAEP38570 1179 aa39.91■■■■□ 3.98
GSC-201ENST00000238558 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.91■■■■□ 3.98
GSC-201ENST00000238558 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
GSC-201ENST00000238558 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
GSC-201ENST00000238558 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.86■■■■□ 3.97
GSC-201ENST00000238558 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.81■■■■□ 3.96
GSC-201ENST00000238558 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
GSC-201ENST00000238558 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.79■■■■□ 3.96
GSC-201ENST00000238558 MED14O60244 1454 aa39.75■■■■□ 3.95
GSC-201ENST00000238558 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
GSC-201ENST00000238558 UNC13BO14795 1591 aa39.74■■■■□ 3.95
GSC-201ENST00000238558 NOS1P29475 1434 aa39.74■■■■□ 3.95
GSC-201ENST00000238558 IDI1Q13907 227 aa39.72■■■■□ 3.95
GSC-201ENST00000238558 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.7■■■■□ 3.95
GSC-201ENST00000238558 SYNMO15061 1565 aa39.7■■■■□ 3.95
GSC-201ENST00000238558 PIK3C2BO00750 1634 aa39.69■■■■□ 3.94
GSC-201ENST00000238558 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
GSC-201ENST00000238558 TET3O43151 1660 aa39.67■■■■□ 3.94
GSC-201ENST00000238558 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.66■■■■□ 3.94
GSC-201ENST00000238558 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.66■■■■□ 3.94
GSC-201ENST00000238558 SLIT1O75093 1534 aa39.65■■■■□ 3.94
GSC-201ENST00000238558 IQGAP1P46940 1657 aa39.64■■■■□ 3.94
GSC-201ENST00000238558 LTKP29376 864 aa39.63■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.63■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.62■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 NUP155O75694 1391 aa39.6■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.6■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.59■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 EID1Q9Y6B2 187 aa39.58■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.58■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
GSC-201ENST00000238558 CPS1P31327 1500 aa39.54■■■■□ 3.92
GSC-201ENST00000238558 E9PCH4 1651 aa39.51■■■■□ 3.92
GSC-201ENST00000238558 ADGRB3O60242 1522 aa39.51■■■■□ 3.92
GSC-201ENST00000238558 NAIPQ13075 1403 aa39.48■■■■□ 3.91
GSC-201ENST00000238558 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.45■■■■□ 3.91
GSC-201ENST00000238558 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.38■■■■□ 3.89
GSC-201ENST00000238558 HFM1A2PYH4 1435 aa39.37■■■■□ 3.89
GSC-201ENST00000238558 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.36■■■■□ 3.89
GSC-201ENST00000238558 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
GSC-201ENST00000238558 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.34■■■■□ 3.89
GSC-201ENST00000238558 ZFYVE9O95405 1425 aa39.31■■■■□ 3.88
GSC-201ENST00000238558 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.3■■■■□ 3.88
GSC-201ENST00000238558 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.3■■■■□ 3.88
GSC-201ENST00000238558 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.29■■■■□ 3.88
GSC-201ENST00000238558 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
GSC-201ENST00000238558 TOM1O60784 492 aa39.26■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms