RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	ADORA2A	P29274	412 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	BMP8B	P34820	402 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	GIPR	P48546	466 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CD163	Q86VB7	1156 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CDH23	Q9H251	3354 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	DNAJA2	O60884	412 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CAPN2	P17655	700 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ADD2	P35612	726 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	COG2	Q14746	738 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	NKG7	Q16617	165 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	SGO2	Q562F6	1265 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	LBX2	Q6XYB7	198 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	DPP9	Q86TI2	863 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	HID1	Q8IV36	788 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	TDH	Q8IZJ6	230 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	TTC28	Q96AY4	2481 aa		6.6	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	FLOT1	O75955	427 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	PGK2	P07205	417 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	HOXC6	P09630	235 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	BMP3	P12645	472 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CYBA	P13498	195 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ICA1	Q05084	483 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	CERS3	Q8IU89	383 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	KCT2	Q8NC54	265 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM13C	Q8NE31	585 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	FERMT2	Q96AC1	680 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	GMIP	Q9P107	970 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	VCAN	P13611	3396 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	GBF1	Q92538	1859 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	NCOR1	O75376	2440 aa		6.59	□□□□□ -1.35
MFSD8-240	ENST00000641658	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	NFIC	P08651	508 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	RTP1	P59025	263 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	RBL2	Q08999	1139 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	C12orf60	Q5U649	245 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	LPAR1	Q92633	364 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM87B	Q96K49	555 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	MYRFL	Q96LU7	910 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	HAUS7	Q99871	368 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		6.59	□□□□□ -1.36
MFSD8-240	ENST00000641658	HMMR	O75330	724 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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