RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNC3Q14003 757 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PHKBQ93100 1093 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS18Q9NS28 235 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM260Q9NX78 707 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 KMT2EQ8IZD2 1858 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAK2O60296 914 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SREBF1P36956 1147 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC26A2P50443 739 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE3AQ05086 875 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYGNQ8WXF5 182 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM2Q99965 735 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CWH43Q9H720 699 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TLE6Q9H808 572 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 LRFN2Q9ULH4 789 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 HBP1O60381 514 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF18O76093 207 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM189BP81408 668 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP6Q16828 381 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 BRAPQ7Z569 592 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO15AQ9UKN7 3530 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TBKBP1A7MCY6 615 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM86B1E9PN63 330 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS3O15072 1205 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS6KA5O75582 802 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 NAPAP54920 295 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT85P78386 507 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM29Q14134 588 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 DSC3Q14574 896 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM228AQ86W67 206 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR9Q9NR96 1032 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF19AQ9NV58 838 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP45Q9UL16 551 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1HO95180 2353 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa27.13■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 XBP1P17861 261 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC24A5Q71RS6 500 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 NIPA1Q7RTP0 329 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PBXIP1Q96AQ6 731 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 S1PR5Q9H228 398 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf112Q9NSG2 853 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GINS2Q9Y248 185 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 COL1A2P08123 1366 aa27.13■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 C22orf31O95567 290 aa27.12■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ASIC4Q96FT7 647 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR32O75388 356 aa27.11■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY7P51828 1080 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PKN1Q16512 942 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL40Q2TBA0 621 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC55Q6ZSA7 311 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 FERMT3Q86UX7 667 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 BARHL2Q9NY43 387 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 V9GY48 417 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 AP3B2Q13367 1082 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 KIZQ2M2Z5 673 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF484Q5JVG2 852 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R16BQ96T49 567 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 SMCO2A6NFE2 343 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 BACH1O14867 736 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MBD3O95983 291 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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CAPNS1-216ENST00000628306 PDXDC2PQ6P474 469 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCE2Q6PIF2 218 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF302Q9NR11 478 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM161AQ9NX61 479 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND3A2RUS2 1198 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM160B1Q5W0V3 765 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL6Q8N531 539 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01465Q8N7H1 131 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-216ENST00000628306 RASGRP4Q8TDF6 673 aa27.09■■□□□ 1.93
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