RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A8Q8NDX2 589 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A3Q8WY07 619 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 Q9Y3F1 56 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NJR5 290 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ENM7 598 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT31Q15323 416 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD14CQ5VZR4 134 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM114A1Q8IWE2 563 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 SPIRE2Q8WWL2 714 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 BSNDQ8WZ55 320 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 RNPEPQ9H4A4 650 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GTH6 734 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR25O00155 361 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 NPTX2P47972 431 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2BQ00403 316 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 DGKDQ16760 1214 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TLK2Q86UE8 772 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPV1Q8NER1 839 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 INTS13Q9NVM9 706 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPC6Q9Y210 931 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 CYBAP13498 195 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL2P36404 184 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 HAUS6Q7Z4H7 955 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC8Q8IYI6 725 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 CD99L2Q8TCZ2 262 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF2KMTQ96G04 330 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC16A4O15374 487 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TGFB1I1O43294 461 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 CALUO43852 315 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF286BP0CG31 522 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR1A1P14550 325 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 SMTNP53814 917 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 NR1I3Q14994 352 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 KSR1Q8IVT5 923 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM143Q96AN5 459 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP63Q96MT8 703 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 SRRDQ9UH36 339 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BRB1 525 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TPM3P06753 285 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 DRC7Q8IY82 874 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 SPC24Q8NBT2 197 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 IFT74Q96LB3 600 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 KMT5AQ9NQR1 393 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNG1Q9UIX4 513 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC169A6NNP5 214 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 GAS2O43903 313 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXD10P28358 340 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 COPB1P53618 953 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 NFIL3Q16649 462 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF484Q5JVG2 852 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-215ENST00000628018 FILIP1LQ4L180 1135 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 CREBRFQ8IUR6 639 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 HVCN1Q96D96 273 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM206Q9H813 350 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TAB2Q9NYJ8 693 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 GNRH1P01148 92 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 INSRRP14616 1297 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 GLRA2P23416 452 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM9Q13443 819 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ASAP3Q8TDY4 903 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNN1Q92952 543 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ACCSQ96QU6 501 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 AP5M1Q9H0R1 490 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 GBP3Q9H0R5 595 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 IKZF4Q9H2S9 585 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 COL1A2P08123 1366 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 NR2F2P24468 414 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 CPT1AP50416 773 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 IER5Q5VY09 327 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS16Q9H269 839 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 CETN3O15182 167 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 PTMAP06454 111 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-215ENST00000628018 NAMPTP43490 491 aa27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 205.2 ms