RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617967.4

ATG9B-211, Transcript of autophagy related 9B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG9B, Length 2,777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9B-211ENST00000617967 FAM153BP0C7A2 387 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 PPP1R2P41236 205 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 PEX3P56589 373 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FAM153CQ494X1 144 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 PADI6Q6TGC4 694 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 JDP2Q8WYK2 163 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CCDC169A6NNP5 214 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 GUCY2DQ02846 1103 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 EPC2Q52LR7 807 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FIGNQ5HY92 759 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SELENOOQ9BVL4 669 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 RAB21Q9UL25 225 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 MAP2K7O14733 419 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 MAGEA9P43362 315 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 HMGCS2P54868 508 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SLC18A3Q16572 532 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 MICALL2Q8IY33 904 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 NFU1Q9UMS0 254 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CEP104O60308 925 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CEP63Q96MT8 703 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CENPHQ9H3R5 247 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 EVI5O60447 810 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FSTL1Q12841 308 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 MTMR1Q13613 665 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 EPHA7Q15375 998 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 BACH1O14867 736 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ITGA4P13612 1032 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CIITAP33076 1130 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 FIZ1Q96SL8 496 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 RMDN3Q96TC7 470 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 MRIQ9BWK5 157 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SIX2Q9NPC8 291 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 HACL1Q9UJ83 578 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 VCAM1P19320 739 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 C8orf74Q6P047 294 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 GBP6Q6ZN66 633 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 SLC5A5Q92911 643 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 BTBD6Q96KE9 485 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 NAGPAQ9UK23 515 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 PDXKO00764 312 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 RNF40O75150 1001 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 ASNSP08243 561 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG9B-211ENST00000617967 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms