RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.86□□□□□ -0.35
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PEX26Q7Z412 305 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WNK4Q96J92 1243 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STK33Q9BYT3 514 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYOZ2Q9NPC6 264 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF14Q9UBS8 474 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NENFQ9UMX5 172 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITGA4P13612 1032 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FERP16591 822 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCLMP48507 274 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RARRES1P49788 294 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPEPPSP55786 919 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYL7Q01449 175 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MTMR1Q13613 665 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFT20Q8IY31 132 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCTD17Q8N5Z5 321 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ELMO3Q96BJ8 720 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL8AQ96BM9 186 aa12.83□□□□□ -0.36
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MKNK1Q9BUB5 465 aa12.83□□□□□ -0.36
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