RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GPR32	O75388	356 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	VTN	P04004	478 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CTSH	P09668	335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CSF2RA	P15509	400 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	ARL2	P36404	184 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GPC3	P51654	580 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	DRP2	Q13474	957 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GPNMB	Q14956	572 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	E2F4	Q16254	413 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SCLY	Q96I15	445 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GDF15	Q99988	308 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SCN5A	Q14524	2016 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900		A0A087X0B3	334 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	NBN	O60934	754 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	BMP8B	P34820	402 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	STAT6	P42226	847 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	MCM6	Q14566	821 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PDILT	Q8N807	584 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SI	P14410	1827 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	TET1	Q8NFU7	2136 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	TFDP1	Q14186	410 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	VWCE	Q96DN2	955 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900		A0A087WZ62	844 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1B0GVL5	298 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PFKFB1	P16118	471 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GLRA2	P23416	452 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	LPIN1	Q14693	890 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	DAW1	Q8N136	415 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	APBB2	Q92870	758 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	MYH11	P35749	1972 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GPR182	O15218	404 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	HIP1R	O75146	1068 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	FGB	P02675	491 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	GHR	P10912	638 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PKN1-208	ENST00000586900	SYK	P43405	635 aa		13.65	□□□□□ -0.22

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