RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	MBTPS1	Q14703	1052 aa		27.72	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		27.72	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PFKM	P08237	780 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PDILT	Q8N807	584 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03	9e-10	■□□□□ 8.3
GPS1-223	ENST00000584229	PANK2	Q9BZ23	570 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		27.71	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	ZBBX	A8MT70	800 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G4B	P0C869	781 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	ACTN1	P12814	892 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GPC3	P51654	580 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF365	Q70YC5	407 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	KSR1	Q8IVT5	923 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		27.7	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	FGB	P02675	491 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	STAT6	P42226	847 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	SHC4	Q6S5L8	630 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		27.69	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GPR32	O75388	356 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	PAK2	Q13177	524 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	MCM6	Q14566	821 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	LPIN1	Q14693	890 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GPNMB	Q14956	572 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM240	Q5SV17	173 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT8	Q92599	483 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RAD54L	Q92698	747 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087WZ62	844 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RPS6KA5	O75582	802 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CXCL10	P02778	98 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CYP11B2	P19099	503 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CD52	P31358	61 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	POLD4	Q9HCU8	107 aa		27.67	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	BMP8B	P34820	402 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	CDC42EP1	Q00587	391 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	SHH	Q15465	462 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GPBP1	Q86WP2	473 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC15	Q8TF66	581 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	STK17A	Q9UEE5	414 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRS	Q13332	1948 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	SLC12A3	P55017	1021 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	TFDP1	Q14186	410 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RESP18	Q5W5W9	173 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF410	Q86VK4	478 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	TDH	Q8IZJ6	230 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	RNF149	Q8NC42	400 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	DHX58	Q96C10	678 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GBF1	Q92538	1859 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087X0B3	334 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	ASAP2	O43150	1006 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	USP38	Q8NB14	1042 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	VWCE	Q96DN2	955 aa		27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
GPS1-223	ENST00000584229	HIP1R	O75146	1068 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
GPS1-223	ENST00000584229	FGFR4	P22455	802 aa		27.63	■■■□□ 2.01

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