RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582980.1

CDH8-208, Transcript of cadherin 8, human

TSL 5

Gene CDH8, Length 376 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDH8-208	ENST00000582980	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	TREH	O43280	583 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	CASP1	P29466	404 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	RTP1	P59025	263 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	PTGIS	Q16647	500 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	EVPL	Q92817	2033 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	ASAP2	O43150	1006 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	PLS3	P13797	630 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	ARL2	P36404	184 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	CDK7	P50613	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	CLCN3	P51790	818 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	ZNF131	P52739	623 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	MAPK7	Q13164	816 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	TFDP1	Q14186	410 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	HIC1	Q14526	733 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	KCNB1	Q14721	858 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	DAW1	Q8N136	415 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	NME8	Q8N427	588 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CDH8-208	ENST00000582980	B4GALT4	O60513	344 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	ABCD1	P33897	745 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	NAMPT	P43490	491 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SMTN	P53814	917 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	COASY	Q13057	564 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	PSMD2	Q13200	908 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	PTK7	Q13308	1070 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SNX17	Q15036	470 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	ODR4	Q5SWX8	454 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980		H0YCG3	227 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980		M0QZ92	97 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	KLRC4	O43908	158 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	CAND2	O75155	1236 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	RHOBTB3	O94955	611 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SCP2	P22307	547 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	GLRA2	P23416	452 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	PEX3	P56589	373 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SOX10	P56693	466 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	DRP2	Q13474	957 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CDH8-208	ENST00000582980	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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