RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	FOXS1	O43638	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	BPI	P17213	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MRE11	P49959	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PHC1	P78364	1004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	CDSN	Q15517	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	NME9	Q86XW9	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	LMF1	Q96S06	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ADRB1	P08588	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	LSS	P48449	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TERF2	Q15554	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084		Q8TCH9	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX11-208	ENST00000576084		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	C2orf78	A6NCI8	922 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FKBP9	O95302	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZNF20	P17024	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MASP1	P48740	699 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SCNN1B	P51168	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RAC3	P60763	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ADAM8	P78325	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ADAM15	Q13444	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084		Q6ZSN1	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CR2	P20023	1033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	CD40	P25942	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	STAT3	P40763	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ID4	P47928	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	BCAR1	P56945	870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ACAP1	Q15027	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DHCR24	Q15392	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	DGKD	Q16760	1214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	SMARCA4	P51532	1647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	NEMP1	O14524	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX11-208	ENST00000576084	OPHN1	O60890	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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