RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 HINFPQ9BQA5 517 aa25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 GFPT2O94808 682 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TRIM49P0CI25 452 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TRIM49CP0CI26 452 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SLC7A5Q01650 507 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TNFAIP1Q13829 316 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 CBWD6Q4V339 395 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 DNAAF5Q86Y56 855 aa25.28■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PLS1Q14651 629 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 C8orf74Q6P047 294 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 JDP2Q8WYK2 163 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 STK33Q9BYT3 514 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 GINM1Q9NU53 330 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 STIM2Q9P246 746 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 F8VZ95 297 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SOX5P35711 763 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MTMR1Q13613 665 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 DNAJC12Q9UKB3 198 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 SAMM50Q9Y512 469 aa25.27■■□□□ 1.64
EHD4-202ENST00000569223 EVI5O60447 810 aa25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 EXOC3O60645 756 aa25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 QARSP47897 775 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RARRES1P49788 294 aa25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 SPP2Q13103 211 aa25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 MYBPC2Q14324 1141 aa25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.26■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 LYPLA2O95372 231 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 VCAM1P19320 739 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 MYL7Q01449 175 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 BFSP1Q12934 665 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PGM5Q15124 567 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PARP14Q460N5 1801 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 H2AFZP0C0S5 128 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TNFRSF8P28908 595 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 ALCAMQ13740 583 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 H2AFVQ71UI9 128 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 INTUQ9ULD6 942 aa25.25■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 MTMR2Q13614 643 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RPS6KA1Q15418 735 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TAF4BQ92750 862 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 GPR88Q9GZN0 384 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 CES2O00748 559 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 KIF4AO95239 1232 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PLS3P13797 630 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 BAG6P46379 1132 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 ACCSQ96QU6 501 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TMEM206Q9H813 350 aa25.24■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 DOCK1Q14185 1865 aa25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 PHACTR2O75167 634 aa25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 UGCGQ16739 394 aa25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 RDH13Q8NBN7 331 aa25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 APEX2Q9UBZ4 518 aa25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 ZBED4O75132 1171 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TGFB2P61812 414 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 GOLPH3Q9H4A6 298 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
EHD4-202ENST00000569223 TISP43B9A030 160 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms