RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAPK7Q13164 816 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IER5Q5VY09 327 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAW1Q8N136 415 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEP89Q96ST8 783 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEL1LQ9UBV2 794 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.4□□□□□ -0.9
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BECN2A8MW95 431 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC16A4O15374 487 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYP2C9P11712 490 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL2P36404 184 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R2P41236 205 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRCPP42785 496 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPTX2P47972 431 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF165P49910 485 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLCN3P51790 818 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF131P52739 623 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STX17P56962 302 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EHHADHQ08426 723 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DRP2Q13474 957 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFDP1Q14186 410 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP2R5AQ15172 486 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHPN2Q8IUC4 686 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADSSL1Q8N142 457 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF214Q8ND24 703 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEPTORQ8TB45 409 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NELFBQ8WX92 580 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARMC5Q96C12 935 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF333Q96JL9 665 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAP7D2Q96T17 732 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRDM10Q9NQV6 1147 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKT3Q9Y243 479 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.39□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMTNL1A8MU46 457 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H0YCG3 227 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 K7ENM7 598 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNM1LO00429 736 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMA7O14818 248 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ASAP2O43150 1006 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SGPL1O95470 568 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYBP10242 640 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLRA2P23416 452 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTP1P59025 263 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ITGA7Q13683 1181 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSE1Q14687 1217 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HAUS6Q7Z4H7 955 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KSR1Q8IVT5 923 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms