RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528145.5

ATG13-210, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 3

Gene ATG13, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-210ENST00000528145 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 OSMRQ99650 979 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 GINS2Q9Y248 185 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 PFKMP08237 780 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 PLA2G4BP0C869 781 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 CYP11B2P19099 503 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 SLC12A3P55017 1021 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 LPIN1Q14693 890 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 TCTN1Q2MV58 587 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 RESP18Q5W5W9 173 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 KSR1Q8IVT5 923 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 TCP11Q8WWU5 503 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 RAD54LQ92698 747 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 BMP8BP34820 402 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 ARL2P36404 184 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 MCM6Q14566 821 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 TMEM240Q5SV17 173 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 PDILTQ8N807 584 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 NLRP4Q96MN2 994 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 SCLT1Q96NL6 688 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 STK17AQ9UEE5 414 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG13-210ENST00000528145 A0A087WZ62 844 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 GLRA2P23416 452 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 STAT6P42226 847 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 E2F4Q16254 413 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 ZNF365Q70YC5 407 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 ZNF410Q86VK4 478 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 NLRP7Q8WX94 980 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 BSNDQ8WZ55 320 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 PANK2Q9BZ23 570 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 MYH11P35749 1972 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 PTPRSQ13332 1948 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 HIP1RO75146 1068 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 GUCY2CP25092 1073 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 CD52P31358 61 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 MAPK7Q13164 816 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 CAPSQ13938 189 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 SHHQ15465 462 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 ARSHQ5FYA8 562 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 ADALQ6DHV7 355 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 FAM228AQ86W67 206 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 GPBP1Q86WP2 473 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 DAW1Q8N136 415 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 POLD4Q9HCU8 107 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 SQORQ9Y6N5 450 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG13-210ENST00000528145 FGBP02675 491 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms