RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523939.1

ALKAL1-202, Transcript of ALK and LTK ligand 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALKAL1, Length 536 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1-202ENST00000523939 PLIN2Q99541 437 aa21.49■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 MTRQ99707 1265 aa21.49■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.49■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 CEP290O15078 2479 aa21.49■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.49■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 PLA2G4BP0C869 781 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 DNM2P50570 870 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 POU5F1BQ06416 359 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ARSHQ5FYA8 562 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 TCP11Q8WWU5 503 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 RAD54LQ92698 747 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 MAP7D2Q96T17 732 aa21.48■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 CMA1P23946 247 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 MAPK7Q13164 816 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 KIZQ2M2Z5 673 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 KSR1Q8IVT5 923 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 DAW1Q8N136 415 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 USP38Q8NB14 1042 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 RUSC1Q9BVN2 902 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 STK17AQ9UEE5 414 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 AKT3Q9Y243 479 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 HPSEQ9Y251 543 aa21.47■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ASAP2O43150 1006 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ACRP10323 421 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 GLRA2P23416 452 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 GUCY2CP25092 1073 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF365Q70YC5 407 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF410Q86VK4 478 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 KCND2Q9NZV8 630 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 TET1Q8NFU7 2136 aa21.46■■□□□ 1.03
ALKAL1-202ENST00000523939 A0A1W2PQ27 194 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 A0A1W2PQ64 194 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 A0A1W2PQD8 194 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 TXLNAP40222 546 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 HERVK_113Q902F9 699 aa21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 FGBP02675 491 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 GHRP10912 638 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 MCM6Q14566 821 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 SHHQ15465 462 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 OSMRQ99650 979 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 TIPINQ9BVW5 301 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 PANK2Q9BZ23 570 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 A0A087WZ62 844 aa21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 M0QZ92 97 aa21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CAPSQ13938 189 aa21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 FAM228AQ86W67 206 aa21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 BSNDQ8WZ55 320 aa21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 PADI3Q9ULW8 664 aa21.43■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 A0A1W2PPC1 479 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 CD52P31358 61 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 PTENP60484 403 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 KIFAP3Q92845 792 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 APBB2Q92870 758 aa21.42■■□□□ 1.02
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1147.3 ms