RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.38□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 PRLP01236 227 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 STAT3P40763 770 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 ADCY7P51828 1080 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 KIF11P52732 1056 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 INHBCP55103 352 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 CEP89Q96ST8 783 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.37□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 B4E1Z4 1266 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 M0R2C6 588 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 RGS3P49796 1198 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 INHBEP58166 350 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 SLC6A3Q01959 620 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 DGKDQ16760 1214 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 PLD2O14939 933 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 BPIFB4P59827 614 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 CHST14Q8NCH0 376 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 MIEF2Q96C03 454 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 MAML3Q96JK9 1138 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 PCIF1Q9H4Z3 704 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 ACSS2Q9NR19 701 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.35□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 A0A087X1B8 175 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 IGFALSP35858 605 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 TCIRG1Q13488 830 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 SLFN12LQ6IEE8 588 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.34□□□□□ -1.23
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 PEX11BO96011 259 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ACAP1Q15027 740 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 GAGE13Q4V321 117 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 TTC38Q5R3I4 469 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 GAREM2Q75VX8 874 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 C2orf78A6NCI8 922 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 H7C1D1 291 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 RAPGEF3O95398 923 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 CYP17A1P05093 508 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ANTXR2P58335 489 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ZNF174Q15697 407 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 NME9Q86XW9 330 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 GPHA2Q96T91 129 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 CABP5Q9NP86 173 aa7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 DVL2O14641 736 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ASLP04424 464 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 MAN2A2P49641 1150 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ADAM8P78325 824 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZRM9 215 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 DYDC2Q96IM9 177 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 WDR92Q96MX6 357 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 IL23AQ9NPF7 189 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.31□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 PTPDC1A2A3K4 754 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 OPA1O60313 960 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 SCNN1GP51170 649 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 KRT40Q6A162 431 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 CLEC14AQ86T13 490 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 LILRB2Q8N423 598 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 TCF25Q9BQ70 676 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.3□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 UBE2QL1A1L167 161 aa7.29□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 BCAR1P56945 870 aa7.29□□□□□ -1.24
SGCE-211ENST00000522045 EPHA7Q15375 998 aa7.29□□□□□ -1.24
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