RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBXN11Q5T124 520 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM68Q6AZZ1 485 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIAA1841Q6NSI8 718 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 RASSF3Q86WH2 238 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZZZ3Q8IYH5 903 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 E2F7Q96AV8 911 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 DYDC2Q96IM9 177 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 GNRHR2Q96P88 292 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOX7Q9BT81 388 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CARD11Q9BXL7 1154 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAI1Q9UI46 699 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM184BQ9ULE4 1060 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP18Q9UMW8 372 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 JAG2Q9Y219 1238 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHLDB1Q86UU1 1377 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYPNQ86TC9 1320 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD62A6NC57 917 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 C2orf78A6NCI8 922 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRINP1O60477 761 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 OPHN1O60890 802 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PFKMP08237 780 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CTSWP56202 376 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADCY1Q08828 1119 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPR158Q5T848 1215 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 AGBL4Q5VU57 503 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 BORAQ6PGQ7 559 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 FRMD7Q6ZUT3 714 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM124AQ86V42 546 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 NME9Q86XW9 330 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTKN2Q8IZC4 609 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 LGI4Q8N135 537 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 FERMT2Q96AC1 680 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 BDH2Q9BUT1 245 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 MEGF9Q9H1U4 602 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 DENND2AQ9ULE3 1009 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF536O15090 1300 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 A0A0A6YYJ9 748 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CUTAO60888 179 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 KATNA1O75449 491 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 LGALS4P56470 323 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCAR1P56945 870 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ERVK-21P61565 698 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP2CBP62714 309 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP2CAP67775 309 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCT2P78371 535 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD69Q07108 199 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTMR1Q13613 665 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 NFIXQ14938 502 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 DGKDQ16760 1214 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPROQ16827 1216 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF827Q17R98 1081 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 GAREM2Q75VX8 874 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 REXO1L1PQ8IX06 675 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFNL2Q8IZJ0 200 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNTD1Q8N815 330 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 CFHR4Q92496 578 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-344P-201ENST00000516635 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms