RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.28■■□□□ 1.16
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SMIM20-201ENST00000506197 TIPINQ9BVW5 301 aa22.28■■□□□ 1.16
SMIM20-201ENST00000506197 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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SMIM20-201ENST00000506197 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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SMIM20-201ENST00000506197 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM20-201ENST00000506197 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM20-201ENST00000506197 METTL13Q8N6R0 699 aa22.27■■□□□ 1.16
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SMIM20-201ENST00000506197 NOD1Q9Y239 953 aa22.27■■□□□ 1.16
SMIM20-201ENST00000506197 MYMKA6NI61 221 aa22.26■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 MYL1P05976 194 aa22.26■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.26■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.26■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 A0A0C4DFX4 3053 aa22.26■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.25■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.25■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.25■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 CASP1P29466 404 aa22.23■■□□□ 1.15
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SMIM20-201ENST00000506197 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 HIPK3Q9H422 1215 aa22.23■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 TRAK2O60296 914 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 B4GALT4O60513 344 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 CSF2RAP15509 400 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 GIT2Q14161 759 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.22■■□□□ 1.15
SMIM20-201ENST00000506197 GUCD1Q96NT3 240 aa22.22■■□□□ 1.15
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