RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 CMIPQ8IY22 773 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 MBD6Q96DN6 1003 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRK-215ENST00000498284 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRK-215ENST00000498284 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-215ENST00000498284 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRK-215ENST00000498284 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF827Q17R98 1081 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-215ENST00000498284 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 ORAI2Q96SN7 254 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 VWA7Q9Y334 891 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-215ENST00000498284 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 B4GALT3O60512 393 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 B4GALT4O60513 344 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 CELA3BP08861 270 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 GPR3P46089 330 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 LGALS4P56470 323 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 PPARAQ07869 468 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-215ENST00000498284 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
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