RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487620.1

ZNF3-215, Transcript of zinc finger protein 3, human

TSL 2

Gene ZNF3, Length 2,660 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF3-215	ENST00000487620	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FUK	Q8N0W3	1084 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	C5orf60	A6NFR6	353 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	MEIS2	O14770	477 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	LMNB1	P20700	586 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CYP3A7	P24462	503 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SCNN1D	P51172	638 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM182B	Q5T319	152 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	HOOK3	Q86VS8	718 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ERP44	Q9BS26	406 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	THAP2	Q9H0W7	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RGL1	Q9NZL6	768 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SNX24	Q9Y343	169 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	MME	P08473	750 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CHN1	P15882	459 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DRD4	P21917	467 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PMS2	P54278	862 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PLS1	Q14651	629 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	COG2	Q14746	738 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DENND2C	Q68D51	928 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	AADACL2	Q6P093	401 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	MYCT1	Q8N699	235 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TLCD1	Q96CP7	247 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC26A4	O43511	780 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FAM13A	O94988	1023 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TNFAIP3	P21580	790 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	POLD1	P28340	1107 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	DUPD1	Q68J44	220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PALB2	Q86YC2	1186 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	OPLAH	O14841	1288 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	LRRN2	O75325	713 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	FMO5	P49326	533 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CYP2J2	P51589	502 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	PPAT	Q06203	517 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CBWD6	Q4V339	395 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	JAML	Q86YT9	394 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	CCT6B	Q92526	530 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	ALG3	Q92685	438 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	C18orf8	Q96DM3	657 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZNF3-215	ENST00000487620	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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