RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 LCHNA4D1U4 455 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 SYT1P21579 422 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 MTRQ99707 1265 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 INSL6Q9Y581 213 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.21■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ENPP3O14638 875 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 RPA1P27694 616 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 RARRES1P49788 294 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 POTEGQ6S5H5 508 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 TCP11Q8WWU5 503 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 MYLIPQ8WY64 445 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 YME1L1Q96TA2 773 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 TMX1Q9H3N1 280 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.2■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 TAP1Q03518 808 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 PDIA5Q14554 519 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ZNF410Q86VK4 478 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 TMEM143Q96AN5 459 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 NLRP4Q96MN2 994 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 STK24Q9Y6E0 443 aa23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 A0A087WZ62 844 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 DENND3A2RUS2 1198 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 DGAT1O75907 488 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF15O94989 841 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 NACC1Q96RE7 527 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 FOSL2P15408 326 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 MUTP22033 750 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 KSR1Q8IVT5 923 aa23.18■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 MGEA5O60502 916 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 IL17AQ16552 155 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ADAM2Q99965 735 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 CERS4Q9HA82 394 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 A0A087WWV3 80 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 LINC01553A4QN01 128 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 KRT79Q5XKE5 535 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.16■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 PP2D1A8MPX8 630 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 STX6O43752 255 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 BMP15O95972 392 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 STAG3L1P0CL83 205 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 FGFR4P22455 802 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 RESTQ13127 1097 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 RGS18Q9NS28 235 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 MTMR6Q9Y217 621 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.15■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 MYH11P35749 1972 aa23.14■■□□□ 1.3
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NELFE-208ENST00000481121 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 SPRED2Q7Z698 418 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.14■■□□□ 1.3
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-208ENST00000481121 ASAP2O43150 1006 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-208ENST00000481121 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-208ENST00000481121 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
NELFE-208ENST00000481121 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NELFE-208ENST00000481121 ECM1Q16610 540 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-208ENST00000481121 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.13■■□□□ 1.29
NELFE-208ENST00000481121 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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