RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 RARRES1P49788 294 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 TAP1Q03518 808 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 EMC2Q15006 297 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 ODR4Q5SWX8 454 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 NLRP7Q8WX94 980 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 TMEM143Q96AN5 459 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 MGEA5O60502 916 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 ECM1Q16610 540 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 KSR1Q8IVT5 923 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 MYLIPQ8WY64 445 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 NACC1Q96RE7 527 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 MTMR6Q9Y217 621 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 INSL6Q9Y581 213 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WZ62 844 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 MUTP22033 750 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 RESTQ13127 1097 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 POTEGQ6S5H5 508 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 SPRED2Q7Z698 418 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 ZNF410Q86VK4 478 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 SCLT1Q96NL6 688 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 MTRQ99707 1265 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 RAB34Q9BZG1 259 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 DGAT1O75907 488 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 DSC3Q14574 896 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 TCP11Q8WWU5 503 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 ADAM2Q99965 735 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 RGS18Q9NS28 235 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 STK24Q9Y6E0 443 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 TTC3P53804 2025 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CDH23Q9H251 3354 aa23.35■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 LINC01553A4QN01 128 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 PP2D1A8MPX8 630 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 STX6O43752 255 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 FGFR4P22455 802 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CDC25AP30304 524 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 NLRP4Q96MN2 994 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CERS4Q9HA82 394 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 MYO9BQ13459 2157 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 YME1L1Q96TA2 773 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 DENND3A2RUS2 1198 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 EPOPA6NHQ4 379 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 C9IYK1 514 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ASAP2O43150 1006 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ARL2P36404 184 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 KRT79Q5XKE5 535 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.32■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 USO1O60763 962 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 DGKIO75912 1065 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 BMP15O95972 392 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 FAM189BP81408 668 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ADGRE1Q14246 886 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ARID2Q68CP9 1835 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 RFXAPO00287 272 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 STAG3L1P0CL83 205 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 FOSL2P15408 326 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-21P61565 698 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 CLIC4Q9Y696 253 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.29■■□□□ 1.32
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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