RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	SURF1	Q15526	300 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TAF5	Q15542	800 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TERF2	Q15554	542 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	GPR162	Q16538	588 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	DBN1	Q16643	649 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	EMC10	Q5UCC4	262 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CORO6	Q6QEF8	472 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398		Q8N3U1	123 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	NBPF15	Q8N660	670 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	C7orf31	Q8N865	590 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO30	Q8TB52	745 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	MDM1	Q8TC05	714 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	PLD4	Q96BZ4	506 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CMTM3	Q96MX0	182 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	FNBP1	Q96RU3	617 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJC18	Q9H819	358 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ZWILCH	Q9H900	591 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398		A6NLC8	198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	OPA1	O60313	960 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	SMPD2	O60906	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	OLFM2	O95897	454 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	PDHA1	P08559	390 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ALAS2	P22557	587 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ATP5D	P30049	168 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	KRT9	P35527	623 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CCNF	P41002	786 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	KCNJ6	P48051	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84	9e-7	■■■■□ 20.2
TTC3-214	ENST00000472398	PLTP	P55058	493 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	SLC26A5	P58743	744 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	COG7	P83436	770 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CENPC	Q03188	943 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	C5orf22	Q49AR2	442 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	AARD	Q4LEZ3	155 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TNS4	Q8IZW8	715 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	GJD3	Q8N144	294 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	OR2C3	Q8N628	320 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	BBOF1	Q8ND07	529 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ERMN	Q8TAM6	284 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CEP76	Q8TAP6	659 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	BSND	Q8WZ55	320 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	CNKSR1	Q969H4	720 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	EXOC2	Q96KP1	924 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	TTC25	Q96NG3	672 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	ACPT	Q9BZG2	426 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	VCX3B	Q9H321	246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTC3-214	ENST00000472398	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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