RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGAP6O43182 974 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 YEATS4O95619 227 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 FGRP09769 529 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SLC26A2P50443 739 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CDR1P51861 262 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ACTR2P61160 394 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CYP4A11Q02928 519 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MAP9Q49MG5 647 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 FIBCD1Q8N539 461 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 URGCPQ8TCY9 931 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM260Q9NX78 707 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.58□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TUBB4AP04350 444 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SMTNP53814 917 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LHX8Q68G74 356 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CEP112Q8N8E3 955 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 VPS16Q9H269 839 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 STK24Q9Y6E0 443 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 NRCAMQ92823 1304 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 HOXA2O43364 376 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SLFN14P0C7P3 912 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RFC2P35250 354 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SYCP1Q15431 976 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF174Q15697 407 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GRIK4Q16099 956 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM50Q86XT4 487 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TCP11Q8WWU5 503 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SENP2Q9HC62 589 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 INSRRP14616 1297 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CTNNB1P35222 781 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 USP11P51784 963 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 STIM1Q13586 685 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BRAPQ7Z569 592 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PARP2Q9UGN5 583 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.57□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 UTRNP46939 3433 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PFKFB2O60825 505 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 BMP15O95972 392 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SNHG28P0DPA3 235 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 KLRC1P26715 233 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CDC25BP30305 580 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 STRN3Q13033 797 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SHHQ15465 462 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TRPV1Q8NER1 839 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 USP6NLQ92738 828 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 IGFLR1Q9H665 355 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 DNM3Q9UQ16 869 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 IDEP14735 1019 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ANTXR2P58335 489 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SPA17Q15506 151 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 FAM212AQ96EL1 285 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM169Q96HH4 297 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PSMB7Q99436 277 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PLIN2Q99541 437 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.56□□□□□ -1.36
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1W2PPC1 479 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms