RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 INTS13Q9NVM9 706 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 MYBP10242 640 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 C1QTNF8P60827 252 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 KCNA1Q09470 495 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PLCB4Q15147 1175 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM139Q8IV31 216 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 KSR1Q8IVT5 923 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 FIZ1Q96SL8 496 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 CEP89Q96ST8 783 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 MMP3P08254 477 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 CYBAP13498 195 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PAK1Q13153 545 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TLK2Q86UE8 772 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.5■□□□□ 0.87
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CAPN3-209ENST00000466222 KCND2Q9NZV8 630 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 FKTNO75072 461 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 CNGA1P29973 690 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF131P52739 623 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 BEX3Q00994 111 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PSMD2Q13200 908 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ODR4Q5SWX8 454 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 EMSYQ7Z589 1322 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ELF2Q15723 593 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1B0GTH6 734 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PPFIA4O75335 1185 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 HOXD13P35453 343 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 CHMP4BP1P59074 171 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SPATA1Q5VX52 437 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 BSNDQ8WZ55 320 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM143Q96AN5 459 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TRPC6Q9Y210 931 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 MYADML2A6NDP7 307 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ADCY3O60266 1144 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TPM1P09493 284 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 DRP2Q13474 957 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NR1I3Q14994 352 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 DNAI1Q9UI46 699 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 A6NJR5 290 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PSMA7O14818 248 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 DGAT1O75907 488 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 GCNT3O95395 438 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 TC2NQ8N9U0 490 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 H3BRB1 525 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 AKR1A1P14550 325 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 PEX3P56589 373 aa20.46■□□□□ 0.87
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