RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 GPC3P51654 580 aa20.31■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 USP38Q8NB14 1042 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 PRO3102Q9H379 93 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.31■□□□□ 0.84
PTX4-202ENST00000440447 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 RAD54LQ92698 747 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.28■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.27■□□□□ 0.84
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PTX4-202ENST00000440447 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.26■□□□□ 0.83
PTX4-202ENST00000440447 KCND2Q9NZV8 630 aa20.26■□□□□ 0.83
PTX4-202ENST00000440447 EVPLQ92817 2033 aa20.26■□□□□ 0.83
PTX4-202ENST00000440447 ARID2Q68CP9 1835 aa20.25■□□□□ 0.83
PTX4-202ENST00000440447 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.25■□□□□ 0.83
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PTX4-202ENST00000440447 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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