RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 HYIQ5T013 277 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTI2Q6NXR4 508 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC174Q6PII3 467 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCTD1Q719H9 257 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF180Q86T96 592 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO11Q86XK2 927 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTRQ99707 1265 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPVLQ9H3G5 476 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD320Q9NPF0 282 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM260Q9NX78 707 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 OGFRQ9NZT2 677 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 LHX6Q9UPM6 363 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR33A8MZF0 331 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC37A4O43826 429 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERLIN1O75477 346 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 BMP3P12645 472 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 IDEP14735 1019 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 VCAM1P19320 739 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC25AP30304 524 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 STAT2P52630 851 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBED6P86452 979 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 NHLH1Q02575 133 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRB10Q13322 594 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPA17Q15506 151 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA1328Q86T90 577 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT222Q8N1A0 295 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAML3Q96JK9 1138 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM20AQ96MK3 541 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP63Q96MT8 703 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MED15Q96RN5 788 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLIN2Q99541 437 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC7Q99615 494 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GBP3Q9H0R5 595 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 PNMA2Q9UL42 364 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 COG5Q9UP83 839 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC37A2A6NM11 1700 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 RFXAPO00287 272 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP8B1O43520 1251 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAMTS4O75173 837 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFA10O95299 355 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GH2P01242 217 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYOGP15173 224 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERCC3P19447 782 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP3A7P24462 503 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF76P36508 570 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 SREBF1P36956 1147 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACLYP53396 1101 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 RABGGTBP53611 331 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 USP14P54578 494 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM193AP78312 1265 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARHGAP4P98171 946 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDK17Q00537 523 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPS2Q13227 327 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2SQ16763 222 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms