RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429205.6

SENP3-202, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SENP3, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-202ENST00000429205 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SLC5A5Q92911 643 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PARP14Q460N5 1801 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 OTOFQ9HC10 1997 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PSMA7O14818 248 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SLC26A4O43511 780 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ITGB5P18084 799 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 LIG3P49916 1009 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PSMC6P62333 389 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CYP4A11Q02928 519 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 STIM1Q13586 685 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TRIM65Q6PJ69 517 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SLC35B4Q969S0 331 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 A0A1B0GTH6 734 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CCDC151A5D8V7 595 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RNF8O76064 485 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 IDO1P14902 403 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ARHGAP25P42331 645 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NAA25Q14CX7 972 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NSMFQ6X4W1 530 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MOB2Q70IA6 237 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TRIM58Q8NG06 486 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NEK9Q8TD19 979 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CARD6Q9BX69 1037 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RNF146Q9NTX7 359 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CSADQ9Y600 493 aa14.66□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 WDR90Q96KV7 1748 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 A6NNZ2 444 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CHMP2AO43633 222 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ATP6V1G1O75348 118 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 KIF4AO95239 1232 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NR1I3Q14994 352 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EPC1Q9H2F5 836 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PNMA2Q9UL42 364 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TMEM221A6NGB7 291 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 GAS7O60861 476 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EHHADHQ08426 723 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DRP2Q13474 957 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CUL3Q13618 768 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TTI2Q6NXR4 508 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 GPBP1Q86WP2 473 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CDCA5Q96FF9 252 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.65□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 TEX33O43247 280 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 SLC12A3P55017 1021 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 PPP2R5CQ13362 524 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.64□□□□□ -0.07
SENP3-202ENST00000429205 TREML2Q5T2D2 321 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms