RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPHB2	P29323	1055 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADCY1	Q08828	1119 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIS12	Q9H081	205 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		11.3	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM247	A6NEH6	219 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNK3	O14649	394 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HPCA	P84074	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYH3	P11055	1940 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB43	O43298	467 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ECE2	O60344	883 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NACA2	Q9H009	215 aa		11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLSCR1	O15162	318 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGEB3	O15480	346 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTI1	O43156	1089 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUDT17	P0C025	328 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MLH1	P40692	756 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GIT2	Q14161	759 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP7	Q14244	749 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPATA24	Q86W54	205 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VSIG1	Q86XK7	387 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF213	O14771	459 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGT	P01019	485 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITGA4	P13612	1032 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	YY1	P25490	414 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLRC1	P26715	233 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HAUS1	Q96CS2	278 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPP4	Q96JB8	637 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FMO2	Q99518	471 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VAV1	P15498	845 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VCAM1	P19320	739 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMNB2	Q03252	620 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RCN1	Q15293	331 aa		11.28	□□□□□ -0.6
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAB2	Q15742	525 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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